Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
TRAM1Q15629 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TRAM1Q15629 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TRAM1Q15629 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TRAM1Q15629 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TRAM1Q15629 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TRAM1Q15629 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TRAM1Q15629 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TRAM1Q15629 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TRAM1Q15629 MIR8062-201ENST00000621515 85 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TRAM1Q15629 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
TRAM1Q15629 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TRAM1Q15629 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TRAM1Q15629 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TRAM1Q15629 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
TRAM1Q15629 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TRAM1Q15629 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TRAM1Q15629 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TRAM1Q15629 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TRAM1Q15629 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TRAM1Q15629 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
TRAM1Q15629 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TRAM1Q15629 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
TRAM1Q15629 RNY1P11-201ENST00000363759 113 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TRAM1Q15629 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TRAM1Q15629 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
TRAM1Q15629 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
TRAM1Q15629 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
TRAM1Q15629 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
TRAM1Q15629 MIR198-201ENST00000637333 62 ntBASIC-1.64□□□□□ -2.67
TRAM1Q15629 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TRAM1Q15629 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TRAM1Q15629 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TRAM1Q15629 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TRAM1Q15629 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TRAM1Q15629 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TRAM1Q15629 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.65□□□□□ -2.67
TRAM1Q15629 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
TRAM1Q15629 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
TRAM1Q15629 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-1.66□□□□□ -2.68
TRAM1Q15629 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
TRAM1Q15629 SNORA62.4-201ENST00000365504 151 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
TRAM1Q15629 Y_RNA.488-201ENST00000384403 102 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
TRAM1Q15629 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
TRAM1Q15629 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
TRAM1Q15629 RNA5SP461-201ENST00000516451 104 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
TRAM1Q15629 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC-1.67□□□□□ -2.68
TRAM1Q15629 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
TRAM1Q15629 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
TRAM1Q15629 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
TRAM1Q15629 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
TRAM1Q15629 SNORD127-201ENST00000458892 86 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
TRAM1Q15629 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
TRAM1Q15629 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
TRAM1Q15629 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
TRAM1Q15629 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-1.68□□□□□ -2.68
TRAM1Q15629 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
TRAM1Q15629 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
TRAM1Q15629 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC-1.69□□□□□ -2.68
TRAM1Q15629 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
TRAM1Q15629 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
TRAM1Q15629 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
TRAM1Q15629 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
TRAM1Q15629 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
TRAM1Q15629 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC-1.7□□□□□ -2.68
TRAM1Q15629 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
TRAM1Q15629 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
TRAM1Q15629 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
TRAM1Q15629 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-1.71□□□□□ -2.68
TRAM1Q15629 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
TRAM1Q15629 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
TRAM1Q15629 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
TRAM1Q15629 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
TRAM1Q15629 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
TRAM1Q15629 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
TRAM1Q15629 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
TRAM1Q15629 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
TRAM1Q15629 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
TRAM1Q15629 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
TRAM1Q15629 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
TRAM1Q15629 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
TRAM1Q15629 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
TRAM1Q15629 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TRAM1Q15629 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TRAM1Q15629 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TRAM1Q15629 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TRAM1Q15629 DNAJC19P2-201ENST00000593340 302 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
TRAM1Q15629 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TRAM1Q15629 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TRAM1Q15629 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TRAM1Q15629 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TRAM1Q15629 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TRAM1Q15629 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TRAM1Q15629 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
TRAM1Q15629 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
TRAM1Q15629 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
TRAM1Q15629 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
TRAM1Q15629 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
TRAM1Q15629 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
TRAM1Q15629 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
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