Protein–RNA interactions for Protein: Q15120

PDK3, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK3Q15120 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PDK3Q15120 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC-1.21□□□□□ -2.6
PDK3Q15120 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PDK3Q15120 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PDK3Q15120 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PDK3Q15120 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PDK3Q15120 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PDK3Q15120 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PDK3Q15120 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-1.22□□□□□ -2.6
PDK3Q15120 Y_RNA.668-201ENST00000516233 93 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PDK3Q15120 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PDK3Q15120 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PDK3Q15120 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PDK3Q15120 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PDK3Q15120 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-1.22□□□□□ -2.6
PDK3Q15120 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 RNU6-24P-201ENST00000384440 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-1.23□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-1.23□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC-1.24□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 MIR548D2-201ENST00000384955 97 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-1.25□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 MIR3121-201ENST00000579680 77 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 AC062037.2-201ENST00000610137 73 ntBASIC-1.26□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 RNU6-915P-201ENST00000364943 103 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 MIR1263-201ENST00000408324 86 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-1.27□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 MIR587-201ENST00000384845 96 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 RNU6-460P-201ENST00000391158 108 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 MIR3179-1-201ENST00000578940 84 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 MIR3179-2-201ENST00000579107 84 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-1.28□□□□□ -2.61
PDK3Q15120 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PDK3Q15120 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PDK3Q15120 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PDK3Q15120 RNU6-10P-201ENST00000384036 107 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PDK3Q15120 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PDK3Q15120 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PDK3Q15120 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-1.29□□□□□ -2.62
PDK3Q15120 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PDK3Q15120 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PDK3Q15120 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PDK3Q15120 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PDK3Q15120 MIR518B-201ENST00000385127 83 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PDK3Q15120 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC-1.3□□□□□ -2.62
PDK3Q15120 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PDK3Q15120 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PDK3Q15120 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-1.31□□□□□ -2.62
PDK3Q15120 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PDK3Q15120 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PDK3Q15120 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-1.32□□□□□ -2.62
PDK3Q15120 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PDK3Q15120 SNORD22.1-201ENST00000516331 125 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PDK3Q15120 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PDK3Q15120 Y_RNA.812-201ENST00000610788 101 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PDK3Q15120 Y_RNA.784-201ENST00000613803 101 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PDK3Q15120 Y_RNA.787-201ENST00000616522 101 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PDK3Q15120 Y_RNA.780-201ENST00000617336 101 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PDK3Q15120 Y_RNA.801-201ENST00000619005 101 ntBASIC-1.33□□□□□ -2.62
PDK3Q15120 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PDK3Q15120 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PDK3Q15120 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PDK3Q15120 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PDK3Q15120 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.34□□□□□ -2.62
PDK3Q15120 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PDK3Q15120 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PDK3Q15120 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PDK3Q15120 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PDK3Q15120 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
PDK3Q15120 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC-1.35□□□□□ -2.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 343 ms