Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

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Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
COL19A1Q14993 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
COL19A1Q14993 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
COL19A1Q14993 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
COL19A1Q14993 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
COL19A1Q14993 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
COL19A1Q14993 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
COL19A1Q14993 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
COL19A1Q14993 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
COL19A1Q14993 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
COL19A1Q14993 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
COL19A1Q14993 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
COL19A1Q14993 AC079150.2-201ENST00000443733 78 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
COL19A1Q14993 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
COL19A1Q14993 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
COL19A1Q14993 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
COL19A1Q14993 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
COL19A1Q14993 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
COL19A1Q14993 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
COL19A1Q14993 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
COL19A1Q14993 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
COL19A1Q14993 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
COL19A1Q14993 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
COL19A1Q14993 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
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COL19A1Q14993 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
COL19A1Q14993 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
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COL19A1Q14993 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
COL19A1Q14993 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
COL19A1Q14993 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
COL19A1Q14993 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
COL19A1Q14993 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
COL19A1Q14993 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
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COL19A1Q14993 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.73□□□□□ -2.13
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COL19A1Q14993 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
COL19A1Q14993 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.72□□□□□ -2.13
COL19A1Q14993 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
COL19A1Q14993 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
COL19A1Q14993 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
COL19A1Q14993 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.72□□□□□ -2.13
COL19A1Q14993 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COL19A1Q14993 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COL19A1Q14993 MIR633-201ENST00000384821 98 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COL19A1Q14993 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COL19A1Q14993 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COL19A1Q14993 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COL19A1Q14993 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COL19A1Q14993 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
COL19A1Q14993 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COL19A1Q14993 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COL19A1Q14993 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COL19A1Q14993 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COL19A1Q14993 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
COL19A1Q14993 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.69□□□□□ -2.14
COL19A1Q14993 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL19A1Q14993 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL19A1Q14993 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL19A1Q14993 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL19A1Q14993 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL19A1Q14993 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL19A1Q14993 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL19A1Q14993 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL19A1Q14993 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL19A1Q14993 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
COL19A1Q14993 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.68□□□□□ -2.14
COL19A1Q14993 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
COL19A1Q14993 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
COL19A1Q14993 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
COL19A1Q14993 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
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