Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NFIXQ14938 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NFIXQ14938 RNU6-614P-201ENST00000384369 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NFIXQ14938 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NFIXQ14938 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NFIXQ14938 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NFIXQ14938 U6.59-201ENST00000615686 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NFIXQ14938 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NFIXQ14938 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NFIXQ14938 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NFIXQ14938 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NFIXQ14938 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NFIXQ14938 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NFIXQ14938 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NFIXQ14938 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NFIXQ14938 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NFIXQ14938 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NFIXQ14938 RNA5SP480-201ENST00000516840 109 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NFIXQ14938 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NFIXQ14938 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NFIXQ14938 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NFIXQ14938 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NFIXQ14938 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NFIXQ14938 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NFIXQ14938 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NFIXQ14938 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NFIXQ14938 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NFIXQ14938 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NFIXQ14938 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NFIXQ14938 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NFIXQ14938 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NFIXQ14938 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NFIXQ14938 RPS29P1-201ENST00000465274 159 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NFIXQ14938 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NFIXQ14938 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NFIXQ14938 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
NFIXQ14938 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NFIXQ14938 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NFIXQ14938 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NFIXQ14938 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NFIXQ14938 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NFIXQ14938 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
NFIXQ14938 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NFIXQ14938 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
NFIXQ14938 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NFIXQ14938 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NFIXQ14938 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NFIXQ14938 MIR6515-201ENST00000619843 57 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
NFIXQ14938 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
NFIXQ14938 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.57□□□□□ -2.16
NFIXQ14938 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NFIXQ14938 RNU6-446P-201ENST00000362827 106 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NFIXQ14938 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NFIXQ14938 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NFIXQ14938 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NFIXQ14938 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NFIXQ14938 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NFIXQ14938 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
NFIXQ14938 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NFIXQ14938 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NFIXQ14938 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NFIXQ14938 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NFIXQ14938 AC087277.2-201ENST00000533203 151 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NFIXQ14938 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NFIXQ14938 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NFIXQ14938 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NFIXQ14938 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NFIXQ14938 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NFIXQ14938 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NFIXQ14938 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NFIXQ14938 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.54□□□□□ -2.16
NFIXQ14938 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NFIXQ14938 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NFIXQ14938 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NFIXQ14938 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NFIXQ14938 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NFIXQ14938 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NFIXQ14938 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NFIXQ14938 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NFIXQ14938 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NFIXQ14938 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NFIXQ14938 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NFIXQ14938 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NFIXQ14938 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
NFIXQ14938 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NFIXQ14938 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NFIXQ14938 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NFIXQ14938 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NFIXQ14938 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NFIXQ14938 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NFIXQ14938 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NFIXQ14938 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NFIXQ14938 MIR151B-201ENST00000584249 96 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NFIXQ14938 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NFIXQ14938 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NFIXQ14938 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NFIXQ14938 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NFIXQ14938 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC1.51□□□□□ -2.17
NFIXQ14938 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NFIXQ14938 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
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