Protein–RNA interactions for Protein: Q14596

NBR1, Next to BRCA1 gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 966 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBR1Q14596 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
NBR1Q14596 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NBR1Q14596 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NBR1Q14596 MTND4LP19-201ENST00000403051 166 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NBR1Q14596 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NBR1Q14596 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NBR1Q14596 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NBR1Q14596 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
NBR1Q14596 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NBR1Q14596 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NBR1Q14596 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NBR1Q14596 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.29□□□□□ -2.04
NBR1Q14596 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
NBR1Q14596 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
NBR1Q14596 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NBR1Q14596 RNU6-987P-201ENST00000384759 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NBR1Q14596 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NBR1Q14596 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NBR1Q14596 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC2.28□□□□□ -2.04
NBR1Q14596 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NBR1Q14596 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NBR1Q14596 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NBR1Q14596 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
NBR1Q14596 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NBR1Q14596 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
NBR1Q14596 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
NBR1Q14596 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NBR1Q14596 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NBR1Q14596 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NBR1Q14596 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
NBR1Q14596 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NBR1Q14596 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NBR1Q14596 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NBR1Q14596 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
NBR1Q14596 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NBR1Q14596 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NBR1Q14596 RNU4-37P-201ENST00000410214 84 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NBR1Q14596 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NBR1Q14596 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
NBR1Q14596 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NBR1Q14596 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NBR1Q14596 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NBR1Q14596 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
NBR1Q14596 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
NBR1Q14596 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NBR1Q14596 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
NBR1Q14596 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
NBR1Q14596 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NBR1Q14596 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
NBR1Q14596 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NBR1Q14596 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NBR1Q14596 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
NBR1Q14596 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NBR1Q14596 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
NBR1Q14596 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.2□□□□□ -2.06
NBR1Q14596 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
NBR1Q14596 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NBR1Q14596 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NBR1Q14596 MTND4LP1-201ENST00000446263 157 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NBR1Q14596 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NBR1Q14596 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NBR1Q14596 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
NBR1Q14596 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NBR1Q14596 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
NBR1Q14596 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NBR1Q14596 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NBR1Q14596 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NBR1Q14596 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NBR1Q14596 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
NBR1Q14596 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NBR1Q14596 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NBR1Q14596 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NBR1Q14596 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
NBR1Q14596 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
NBR1Q14596 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NBR1Q14596 RNU6-668P-201ENST00000364180 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NBR1Q14596 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NBR1Q14596 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NBR1Q14596 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NBR1Q14596 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NBR1Q14596 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NBR1Q14596 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NBR1Q14596 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NBR1Q14596 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NBR1Q14596 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NBR1Q14596 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NBR1Q14596 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NBR1Q14596 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
NBR1Q14596 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NBR1Q14596 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NBR1Q14596 RNU6-542P-201ENST00000516405 103 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NBR1Q14596 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NBR1Q14596 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NBR1Q14596 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
NBR1Q14596 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NBR1Q14596 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NBR1Q14596 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NBR1Q14596 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
NBR1Q14596 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
NBR1Q14596 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.9 ms