Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

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Length 830 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SCARF1Q14162 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
SCARF1Q14162 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
SCARF1Q14162 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
SCARF1Q14162 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCARF1Q14162 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCARF1Q14162 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCARF1Q14162 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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SCARF1Q14162 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCARF1Q14162 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SCARF1Q14162 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
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SCARF1Q14162 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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SCARF1Q14162 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SCARF1Q14162 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SCARF1Q14162 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SCARF1Q14162 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SCARF1Q14162 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SCARF1Q14162 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SCARF1Q14162 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SCARF1Q14162 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SCARF1Q14162 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
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SCARF1Q14162 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCARF1Q14162 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SCARF1Q14162 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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SCARF1Q14162 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
SCARF1Q14162 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
SCARF1Q14162 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
SCARF1Q14162 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCARF1Q14162 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCARF1Q14162 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCARF1Q14162 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
SCARF1Q14162 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
SCARF1Q14162 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
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SCARF1Q14162 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
SCARF1Q14162 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SCARF1Q14162 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SCARF1Q14162 RNA5SP233-201ENST00000459153 113 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SCARF1Q14162 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SCARF1Q14162 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SCARF1Q14162 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCARF1Q14162 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCARF1Q14162 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SCARF1Q14162 MIR934-201ENST00000401241 83 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCARF1Q14162 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCARF1Q14162 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCARF1Q14162 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCARF1Q14162 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SCARF1Q14162 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SCARF1Q14162 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SCARF1Q14162 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SCARF1Q14162 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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