Protein–RNA interactions for Protein: Q13939

CCIN, Calicin, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCINQ13939 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CCINQ13939 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CCINQ13939 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CCINQ13939 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CCINQ13939 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CCINQ13939 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
CCINQ13939 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CCINQ13939 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CCINQ13939 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CCINQ13939 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CCINQ13939 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CCINQ13939 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CCINQ13939 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CCINQ13939 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CCINQ13939 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CCINQ13939 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CCINQ13939 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CCINQ13939 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCINQ13939 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCINQ13939 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCINQ13939 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCINQ13939 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCINQ13939 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCINQ13939 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCINQ13939 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCINQ13939 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCINQ13939 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CCINQ13939 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCINQ13939 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCINQ13939 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCINQ13939 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCINQ13939 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCINQ13939 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCINQ13939 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCINQ13939 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCINQ13939 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
CCINQ13939 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCINQ13939 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCINQ13939 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCINQ13939 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCINQ13939 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
CCINQ13939 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.61□□□□□ -2.15
CCINQ13939 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
CCINQ13939 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
CCINQ13939 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCINQ13939 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCINQ13939 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCINQ13939 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCINQ13939 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCINQ13939 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
CCINQ13939 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
CCINQ13939 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.6□□□□□ -2.15
CCINQ13939 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCINQ13939 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCINQ13939 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCINQ13939 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCINQ13939 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCINQ13939 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCINQ13939 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCINQ13939 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
CCINQ13939 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCINQ13939 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCINQ13939 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCINQ13939 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCINQ13939 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCINQ13939 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCINQ13939 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCINQ13939 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
CCINQ13939 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCINQ13939 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCINQ13939 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCINQ13939 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCINQ13939 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCINQ13939 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
CCINQ13939 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCINQ13939 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
CCINQ13939 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCINQ13939 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCINQ13939 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCINQ13939 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCINQ13939 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
CCINQ13939 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCINQ13939 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCINQ13939 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
CCINQ13939 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCINQ13939 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CCINQ13939 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCINQ13939 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCINQ13939 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
CCINQ13939 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
CCINQ13939 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCINQ13939 RNA5SP363-201ENST00000365072 115 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCINQ13939 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
CCINQ13939 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCINQ13939 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCINQ13939 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCINQ13939 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
CCINQ13939 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCINQ13939 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
CCINQ13939 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.9 ms