Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 RNU6-226P-201ENST00000363778 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 RNU6-867P-201ENST00000364956 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 SNORD114-3-201ENST00000364969 75 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 MIR4770-201ENST00000579149 58 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 MIR652-201ENST00000385278 98 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 ULK3-223ENST00000631115 126 ntTSL 5 BASIC-0.87□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 RNU6-738P-201ENST00000384531 106 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 SNORD64-201ENST00000386683 67 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 RNU6-1250P-201ENST00000391218 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 uc_338.19-201ENST00000616808 99 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 SNORD18.2-201ENST00000459604 70 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 RNA5SP136-201ENST00000410906 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 Y_RNA.413-201ENST00000384007 102 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 Y_RNA.754-201ENST00000476024 102 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 Y_RNA.790-201ENST00000614282 102 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 Y_RNA.782-201ENST00000614695 102 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
CACNA1SQ13698 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 Y_RNA.145-201ENST00000363527 102 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 RNU6-1318P-201ENST00000365389 103 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 Y_RNA.375-201ENST00000365625 101 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 MIR8485-201ENST00000401372 91 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-0.91□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 MIR517B-201ENST00000385102 67 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 MTND2P23-201ENST00000422990 651 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 RNU6-337P-201ENST00000391243 106 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 RNU7-121P-201ENST00000516604 62 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 U4.2-201ENST00000618561 85 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 RNU6-1307P-201ENST00000391012 103 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 snoR1.1-201ENST00000628177 80 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
CACNA1SQ13698 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
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