Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

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Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SNX1Q13596 RNU6-816P-201ENST00000390914 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SNX1Q13596 RNU6-1268P-201ENST00000391214 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SNX1Q13596 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SNX1Q13596 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SNX1Q13596 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SNX1Q13596 RNA5SP169-201ENST00000517268 117 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
SNX1Q13596 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SNX1Q13596 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SNX1Q13596 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SNX1Q13596 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SNX1Q13596 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SNX1Q13596 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SNX1Q13596 MIR4436A-201ENST00000585278 85 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SNX1Q13596 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
SNX1Q13596 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SNX1Q13596 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SNX1Q13596 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SNX1Q13596 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SNX1Q13596 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SNX1Q13596 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SNX1Q13596 AC093726.3-201ENST00000637588 150 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
SNX1Q13596 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SNX1Q13596 RNU6-901P-201ENST00000384593 106 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SNX1Q13596 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
SNX1Q13596 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SNX1Q13596 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SNX1Q13596 RNU6-900P-201ENST00000384498 102 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SNX1Q13596 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SNX1Q13596 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SNX1Q13596 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SNX1Q13596 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
SNX1Q13596 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SNX1Q13596 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SNX1Q13596 SNORA3B-201ENST00000391305 131 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SNX1Q13596 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
SNX1Q13596 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SNX1Q13596 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SNX1Q13596 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SNX1Q13596 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SNX1Q13596 RPS29P8-201ENST00000445109 171 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SNX1Q13596 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SNX1Q13596 AL391099.1-201ENST00000624635 187 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
SNX1Q13596 SNORD115-25-201ENST00000362619 82 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SNX1Q13596 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SNX1Q13596 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SNX1Q13596 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SNX1Q13596 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
SNX1Q13596 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SNX1Q13596 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
SNX1Q13596 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SNX1Q13596 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SNX1Q13596 SNORD56B-201ENST00000384713 71 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SNX1Q13596 SNORA49-201ENST00000386157 136 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SNX1Q13596 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SNX1Q13596 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
SNX1Q13596 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC-0.9□□□□□ -2.55
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SNX1Q13596 MIR204-201ENST00000385200 110 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SNX1Q13596 snoU13.13-201ENST00000458842 104 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SNX1Q13596 SNORD2-201ENST00000459163 69 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
SNX1Q13596 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC-0.91□□□□□ -2.56
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SNX1Q13596 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
SNX1Q13596 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-0.92□□□□□ -2.56
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SNX1Q13596 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
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SNX1Q13596 SNORD114-4-201ENST00000363962 75 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
SNX1Q13596 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
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SNX1Q13596 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SNX1Q13596 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SNX1Q13596 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
SNX1Q13596 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SNX1Q13596 RNU7-55P-201ENST00000459426 62 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SNX1Q13596 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
SNX1Q13596 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SNX1Q13596 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SNX1Q13596 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SNX1Q13596 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SNX1Q13596 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SNX1Q13596 MIR4280-201ENST00000582178 76 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SNX1Q13596 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SNX1Q13596 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
SNX1Q13596 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
SNX1Q13596 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
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