Protein–RNA interactions for Protein: Q13449

LSAMP, Limbic system-associated membrane protein, humanhuman

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Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSAMPQ13449 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LSAMPQ13449 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LSAMPQ13449 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LSAMPQ13449 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LSAMPQ13449 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC0.97□□□□□ -2.25
LSAMPQ13449 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LSAMPQ13449 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
LSAMPQ13449 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.96□□□□□ -2.26
LSAMPQ13449 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LSAMPQ13449 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
LSAMPQ13449 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.95□□□□□ -2.26
LSAMPQ13449 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LSAMPQ13449 RNU6-716P-201ENST00000365621 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LSAMPQ13449 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LSAMPQ13449 AL450471.1-201ENST00000447509 127 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LSAMPQ13449 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LSAMPQ13449 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LSAMPQ13449 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LSAMPQ13449 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LSAMPQ13449 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
LSAMPQ13449 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC0.95□□□□□ -2.26
LSAMPQ13449 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LSAMPQ13449 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LSAMPQ13449 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LSAMPQ13449 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LSAMPQ13449 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LSAMPQ13449 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
LSAMPQ13449 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LSAMPQ13449 RNU6-129P-201ENST00000391022 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LSAMPQ13449 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.93□□□□□ -2.26
LSAMPQ13449 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LSAMPQ13449 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LSAMPQ13449 AL078612.1-201ENST00000533009 150 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
LSAMPQ13449 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LSAMPQ13449 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LSAMPQ13449 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
LSAMPQ13449 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LSAMPQ13449 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LSAMPQ13449 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
LSAMPQ13449 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC0.92□□□□□ -2.26
LSAMPQ13449 RNY1P8-201ENST00000383970 114 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LSAMPQ13449 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LSAMPQ13449 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LSAMPQ13449 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LSAMPQ13449 RNA5SP227-201ENST00000516184 113 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LSAMPQ13449 RNU6-1108P-201ENST00000516308 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LSAMPQ13449 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
LSAMPQ13449 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LSAMPQ13449 RNU6-478P-201ENST00000363904 110 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LSAMPQ13449 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LSAMPQ13449 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LSAMPQ13449 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LSAMPQ13449 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LSAMPQ13449 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LSAMPQ13449 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
LSAMPQ13449 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LSAMPQ13449 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LSAMPQ13449 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
LSAMPQ13449 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LSAMPQ13449 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LSAMPQ13449 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LSAMPQ13449 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
LSAMPQ13449 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
LSAMPQ13449 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.87□□□□□ -2.27
LSAMPQ13449 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LSAMPQ13449 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LSAMPQ13449 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LSAMPQ13449 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LSAMPQ13449 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
LSAMPQ13449 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LSAMPQ13449 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
LSAMPQ13449 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
LSAMPQ13449 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
LSAMPQ13449 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
LSAMPQ13449 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
LSAMPQ13449 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
LSAMPQ13449 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
LSAMPQ13449 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
LSAMPQ13449 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
LSAMPQ13449 RNU6-279P-201ENST00000391297 101 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
LSAMPQ13449 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
LSAMPQ13449 MIR7107-201ENST00000611489 80 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
LSAMPQ13449 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
LSAMPQ13449 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
LSAMPQ13449 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
LSAMPQ13449 RNU6-857P-201ENST00000515893 110 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
LSAMPQ13449 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
LSAMPQ13449 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
LSAMPQ13449 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LSAMPQ13449 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LSAMPQ13449 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LSAMPQ13449 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LSAMPQ13449 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
LSAMPQ13449 RNU1-141P-201ENST00000364623 158 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
LSAMPQ13449 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC0.82□□□□□ -2.28
LSAMPQ13449 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
LSAMPQ13449 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
LSAMPQ13449 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
LSAMPQ13449 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
LSAMPQ13449 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
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