Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

Predictions only

Length 3,056 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 RNU6-755P-201ENST00000364400 103 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
ATMQ13315 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.88
ATMQ13315 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
ATMQ13315 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
ATMQ13315 RNU6-742P-201ENST00000365289 107 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
ATMQ13315 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
ATMQ13315 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
ATMQ13315 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
ATMQ13315 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
ATMQ13315 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
ATMQ13315 RNU6-1043P-201ENST00000410355 99 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
ATMQ13315 AC100801.1-202ENST00000518266 371 ntTSL 3 BASIC-2.94□□□□□ -2.88
ATMQ13315 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
ATMQ13315 Y_RNA.15-201ENST00000362420 102 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
ATMQ13315 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
ATMQ13315 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
ATMQ13315 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
ATMQ13315 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
ATMQ13315 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
ATMQ13315 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
ATMQ13315 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
ATMQ13315 SNORA18.5-201ENST00000516616 101 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
ATMQ13315 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
ATMQ13315 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
ATMQ13315 SNORD45C-201ENST00000383893 79 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
ATMQ13315 AC007485.1-201ENST00000616755 206 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
ATMQ13315 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
ATMQ13315 RNU6-903P-201ENST00000391270 109 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
ATMQ13315 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
ATMQ13315 RNU7-140P-201ENST00000459546 60 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
ATMQ13315 MIR4317-201ENST00000637586 65 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
ATMQ13315 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
ATMQ13315 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
ATMQ13315 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
ATMQ13315 RNU6-297P-201ENST00000384636 107 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
ATMQ13315 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
ATMQ13315 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
ATMQ13315 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
ATMQ13315 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
ATMQ13315 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
ATMQ13315 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
ATMQ13315 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
ATMQ13315 Y_RNA.192-201ENST00000363977 102 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
ATMQ13315 RNU6-155P-201ENST00000516347 100 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
ATMQ13315 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
ATMQ13315 Y_RNA.72-201ENST00000362894 103 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.89
ATMQ13315 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.89
ATMQ13315 RNU6-810P-201ENST00000364001 107 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
ATMQ13315 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
ATMQ13315 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
ATMQ13315 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
ATMQ13315 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
ATMQ13315 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
ATMQ13315 Y_RNA.542-201ENST00000384641 111 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
ATMQ13315 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
ATMQ13315 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
ATMQ13315 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
ATMQ13315 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
ATMQ13315 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
ATMQ13315 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
ATMQ13315 MIR7110-201ENST00000612638 86 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
ATMQ13315 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
ATMQ13315 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
ATMQ13315 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
ATMQ13315 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
ATMQ13315 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
ATMQ13315 SNORD115.2-201ENST00000391126 59 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
ATMQ13315 MTCO2P29-201ENST00000465212 189 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
ATMQ13315 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
ATMQ13315 MIR545-201ENST00000385085 106 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
ATMQ13315 AL593851.1-201ENST00000426171 157 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
ATMQ13315 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
ATMQ13315 RNU6-1113P-201ENST00000384348 107 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
ATMQ13315 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
ATMQ13315 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
ATMQ13315 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
ATMQ13315 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
ATMQ13315 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
ATMQ13315 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC-3.01□□□□□ -2.89
ATMQ13315 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
ATMQ13315 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
ATMQ13315 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
ATMQ13315 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
ATMQ13315 AC024933.1-201ENST00000608472 348 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
ATMQ13315 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC-3.02□□□□□ -2.89
ATMQ13315 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
ATMQ13315 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
ATMQ13315 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC-3.03□□□□□ -2.89
ATMQ13315 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
ATMQ13315 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
ATMQ13315 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
ATMQ13315 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
ATMQ13315 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
ATMQ13315 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
ATMQ13315 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
ATMQ13315 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
ATMQ13315 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
ATMQ13315 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
ATMQ13315 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
ATMQ13315 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC-3.04□□□□□ -2.9
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