Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-2.33□□□□□ -2.78
PTPRMP28827 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
PTPRMP28827 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
PTPRMP28827 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
PTPRMP28827 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
PTPRMP28827 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
PTPRMP28827 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC-2.33□□□□□ -2.78
PTPRMP28827 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
PTPRMP28827 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
PTPRMP28827 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
PTPRMP28827 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
PTPRMP28827 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
PTPRMP28827 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
PTPRMP28827 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
PTPRMP28827 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
PTPRMP28827 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-2.34□□□□□ -2.78
PTPRMP28827 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
PTPRMP28827 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
PTPRMP28827 AC090616.4-201ENST00000448026 115 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
PTPRMP28827 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
PTPRMP28827 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
PTPRMP28827 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
PTPRMP28827 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
PTPRMP28827 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
PTPRMP28827 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
PTPRMP28827 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
PTPRMP28827 AC018880.2-201ENST00000414265 201 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
PTPRMP28827 DMD-AS3-201ENST00000439592 293 ntTSL 3 BASIC-2.36□□□□□ -2.79
PTPRMP28827 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
PTPRMP28827 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
PTPRMP28827 Y_RNA.186-201ENST00000363899 92 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
PTPRMP28827 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
PTPRMP28827 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
PTPRMP28827 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
PTPRMP28827 Y_RNA.630-201ENST00000411370 108 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
PTPRMP28827 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC-2.37□□□□□ -2.79
PTPRMP28827 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
PTPRMP28827 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
PTPRMP28827 MIR5683-201ENST00000636514 76 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
PTPRMP28827 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
PTPRMP28827 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
PTPRMP28827 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
PTPRMP28827 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
PTPRMP28827 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
PTPRMP28827 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
PTPRMP28827 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
PTPRMP28827 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
PTPRMP28827 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
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PTPRMP28827 RNU6-1238P-201ENST00000517215 102 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
PTPRMP28827 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
PTPRMP28827 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
PTPRMP28827 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
PTPRMP28827 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
PTPRMP28827 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
PTPRMP28827 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
PTPRMP28827 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC-2.41□□□□□ -2.8
PTPRMP28827 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
PTPRMP28827 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
PTPRMP28827 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC-2.42□□□□□ -2.8
PTPRMP28827 MTND4P17-201ENST00000470444 350 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
PTPRMP28827 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
PTPRMP28827 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
PTPRMP28827 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
PTPRMP28827 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
PTPRMP28827 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
PTPRMP28827 Y_RNA.661-201ENST00000516003 99 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
PTPRMP28827 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
PTPRMP28827 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
PTPRMP28827 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
PTPRMP28827 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
PTPRMP28827 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-2.44□□□□□ -2.8
PTPRMP28827 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
PTPRMP28827 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
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PTPRMP28827 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
PTPRMP28827 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
PTPRMP28827 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
PTPRMP28827 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
PTPRMP28827 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
PTPRMP28827 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
PTPRMP28827 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
PTPRMP28827 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
PTPRMP28827 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
PTPRMP28827 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
PTPRMP28827 AC104985.2-201ENST00000620598 500 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
PTPRMP28827 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
PTPRMP28827 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
PTPRMP28827 RPL35AP4-201ENST00000412007 102 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
PTPRMP28827 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
PTPRMP28827 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
PTPRMP28827 AC006254.2-201ENST00000603259 279 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
PTPRMP28827 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
PTPRMP28827 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
PTPRMP28827 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
PTPRMP28827 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
PTPRMP28827 SNORD19-201ENST00000391191 68 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
PTPRMP28827 AP002795.1-201ENST00000534879 84 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
PTPRMP28827 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
PTPRMP28827 AC078883.4-201ENST00000623218 367 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
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