Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYV6

RRN3, RNA polymerase I-specific transcription initiation factor RRN3, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3Q9NYV6 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RRN3Q9NYV6 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.507-201ENST00000384500 99 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RRN3Q9NYV6 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RRN3Q9NYV6 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
RRN3Q9NYV6 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RRN3Q9NYV6 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RRN3Q9NYV6 SNORA40-201ENST00000388090 126 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RRN3Q9NYV6 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RRN3Q9NYV6 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
RRN3Q9NYV6 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RRN3Q9NYV6 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RRN3Q9NYV6 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RRN3Q9NYV6 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
RRN3Q9NYV6 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RRN3Q9NYV6 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
RRN3Q9NYV6 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RRN3Q9NYV6 MIR145-201ENST00000384967 88 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RRN3Q9NYV6 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
RRN3Q9NYV6 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RRN3Q9NYV6 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
RRN3Q9NYV6 RNA5SP368-201ENST00000364298 116 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
RRN3Q9NYV6 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
RRN3Q9NYV6 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
RRN3Q9NYV6 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
RRN3Q9NYV6 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
RRN3Q9NYV6 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
RRN3Q9NYV6 MIR4493-201ENST00000584016 73 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
RRN3Q9NYV6 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
RRN3Q9NYV6 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
RRN3Q9NYV6 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
RRN3Q9NYV6 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
RRN3Q9NYV6 MIR539-201ENST00000365690 78 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
RRN3Q9NYV6 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
RRN3Q9NYV6 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
RRN3Q9NYV6 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
RRN3Q9NYV6 Clostridiales-1.4-201ENST00000636807 150 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RRN3Q9NYV6 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RRN3Q9NYV6 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RRN3Q9NYV6 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RRN3Q9NYV6 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
RRN3Q9NYV6 RNU6-756P-201ENST00000383997 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RRN3Q9NYV6 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RRN3Q9NYV6 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RRN3Q9NYV6 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RRN3Q9NYV6 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RRN3Q9NYV6 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
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RRN3Q9NYV6 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
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RRN3Q9NYV6 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
RRN3Q9NYV6 AC104692.1-201ENST00000472406 90 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
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RRN3Q9NYV6 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
RRN3Q9NYV6 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
RRN3Q9NYV6 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
RRN3Q9NYV6 MIR3671-201ENST00000580455 88 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
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RRN3Q9NYV6 RNU6-1239P-201ENST00000391310 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
RRN3Q9NYV6 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
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RRN3Q9NYV6 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
RRN3Q9NYV6 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
RRN3Q9NYV6 RNU6ATAC22P-201ENST00000516794 89 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
RRN3Q9NYV6 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
RRN3Q9NYV6 AL627230.5-201ENST00000619807 58 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
RRN3Q9NYV6 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
RRN3Q9NYV6 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
RRN3Q9NYV6 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
RRN3Q9NYV6 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
RRN3Q9NYV6 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
RRN3Q9NYV6 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
RRN3Q9NYV6 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
RRN3Q9NYV6 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
RRN3Q9NYV6 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
RRN3Q9NYV6 AC108676.2-201ENST00000605225 163 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
RRN3Q9NYV6 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
RRN3Q9NYV6 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
RRN3Q9NYV6 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
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