Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZ71

PITPNM3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNM3Q9BZ71 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PITPNM3Q9BZ71 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PITPNM3Q9BZ71 AC008267.6-201ENST00000441664 139 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PITPNM3Q9BZ71 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PITPNM3Q9BZ71 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PITPNM3Q9BZ71 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PITPNM3Q9BZ71 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC0.29□□□□□ -2.36
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PITPNM3Q9BZ71 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PITPNM3Q9BZ71 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PITPNM3Q9BZ71 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PITPNM3Q9BZ71 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PITPNM3Q9BZ71 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC0.28□□□□□ -2.36
PITPNM3Q9BZ71 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC0.28□□□□□ -2.36
PITPNM3Q9BZ71 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PITPNM3Q9BZ71 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 MIR643-201ENST00000385267 97 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-1168P-201ENST00000390831 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 RNA5SP134-201ENST00000516492 96 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 MIR3920-201ENST00000581751 86 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-62P-201ENST00000516526 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 RNA5SP484-201ENST00000458857 111 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-313P-201ENST00000516317 112 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 MIR6779-201ENST00000617283 64 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PITPNM3Q9BZ71 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-1327P-201ENST00000365302 105 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 SNORA51.5-201ENST00000384126 131 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 MIR590-201ENST00000385008 97 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 SNORA2A-201ENST00000383885 135 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 MIR4777-201ENST00000583710 86 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC0.19□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 MIR4473-201ENST00000583731 91 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 AC023932.2-201ENST00000603176 175 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 Y_RNA.95-201ENST00000363079 95 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
PITPNM3Q9BZ71 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 268 ms