Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPROQ16827 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPROQ16827 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPROQ16827 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC0.29□□□□□ -2.36
PTPROQ16827 RNU6-815P-201ENST00000384080 113 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPROQ16827 MIR329-2-201ENST00000385029 84 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPROQ16827 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPROQ16827 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPROQ16827 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPROQ16827 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPROQ16827 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC0.28□□□□□ -2.36
PTPROQ16827 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPROQ16827 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPROQ16827 MIR548A3-201ENST00000385297 97 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPROQ16827 RNU7-74P-201ENST00000459104 62 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPROQ16827 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
PTPROQ16827 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC0.27□□□□□ -2.37
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PTPROQ16827 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPROQ16827 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPROQ16827 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPROQ16827 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPROQ16827 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPROQ16827 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPROQ16827 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPROQ16827 MIR760-201ENST00000390220 80 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPROQ16827 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPROQ16827 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPROQ16827 MIR6718-201ENST00000616153 80 ntBASIC0.26□□□□□ -2.37
PTPROQ16827 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPROQ16827 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPROQ16827 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPROQ16827 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
PTPROQ16827 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPROQ16827 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPROQ16827 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPROQ16827 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPROQ16827 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPROQ16827 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPROQ16827 AL670379.3-201ENST00000605040 251 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPROQ16827 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPROQ16827 MIR6759-201ENST00000638110 65 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
PTPROQ16827 RNU6-509P-201ENST00000363519 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPROQ16827 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPROQ16827 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPROQ16827 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
PTPROQ16827 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPROQ16827 SNORD33.1-201ENST00000516213 88 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
PTPROQ16827 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC0.21□□□□□ -2.38
PTPROQ16827 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
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PTPROQ16827 AL035470.1-201ENST00000622571 220 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
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PTPROQ16827 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
PTPROQ16827 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
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PTPROQ16827 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
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PTPROQ16827 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
PTPROQ16827 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
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PTPROQ16827 Y_RNA.163-201ENST00000363702 113 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPROQ16827 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPROQ16827 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPROQ16827 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPROQ16827 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPROQ16827 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
PTPROQ16827 MIR5589-201ENST00000579442 60 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
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