Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 RNA5SP86-201ENST00000390869 98 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC-1.91□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 RNU6-924P-201ENST00000362926 108 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 Y_RNA.698-201ENST00000516798 118 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-1.92□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC-1.93□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 MIR6874-201ENST00000635894 71 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 AC021146.9-201ENST00000512503 156 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 RNY4P20-201ENST00000516678 93 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 SNORD116-1-201ENST00000384335 95 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-1.95□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 ZEB1-AS1-204ENST00000450834 576 ntTSL 3 BASIC-1.96□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 RNU6-164P-201ENST00000364604 103 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 SNORD116-2-201ENST00000384274 95 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 Y_RNA.162-201ENST00000363683 102 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 MIR1285-2-201ENST00000408311 88 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 RNU6-1233P-201ENST00000362922 102 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 RNU6-704P-201ENST00000364162 103 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC-2□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 RNU6-718P-201ENST00000516166 105 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 RNU6-983P-201ENST00000516004 103 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 AC080013.6-201ENST00000606185 215 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 SNORD18.1-201ENST00000363807 70 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 MIR548H1-201ENST00000408610 102 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 MIR1255B2-201ENST00000408618 67 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
NEDD8Q15843 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
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