Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 MIR382-201ENST00000637119 76 ntBASIC-1.72□□□□□ -2.68
VAMP3Q15836 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
VAMP3Q15836 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
VAMP3Q15836 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
VAMP3Q15836 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
VAMP3Q15836 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
VAMP3Q15836 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
VAMP3Q15836 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
VAMP3Q15836 AL137067.1-201ENST00000615933 120 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
VAMP3Q15836 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
VAMP3Q15836 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
VAMP3Q15836 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
VAMP3Q15836 Y_RNA.651-201ENST00000459380 103 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
VAMP3Q15836 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
VAMP3Q15836 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
VAMP3Q15836 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
VAMP3Q15836 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
VAMP3Q15836 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
VAMP3Q15836 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
VAMP3Q15836 RNU5E-3P-201ENST00000515913 68 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
VAMP3Q15836 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
VAMP3Q15836 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
VAMP3Q15836 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
VAMP3Q15836 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
VAMP3Q15836 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
VAMP3Q15836 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
VAMP3Q15836 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
VAMP3Q15836 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
VAMP3Q15836 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
VAMP3Q15836 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
VAMP3Q15836 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
VAMP3Q15836 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
VAMP3Q15836 SNORA7.5-201ENST00000410672 110 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
VAMP3Q15836 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
VAMP3Q15836 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
VAMP3Q15836 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
VAMP3Q15836 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
VAMP3Q15836 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
VAMP3Q15836 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
VAMP3Q15836 Y_RNA.690-201ENST00000516603 95 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
VAMP3Q15836 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
VAMP3Q15836 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
VAMP3Q15836 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
VAMP3Q15836 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
VAMP3Q15836 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
VAMP3Q15836 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
VAMP3Q15836 MIR3165-201ENST00000579874 75 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
VAMP3Q15836 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
VAMP3Q15836 MIR6773-201ENST00000612812 74 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
VAMP3Q15836 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
VAMP3Q15836 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
VAMP3Q15836 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
VAMP3Q15836 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
VAMP3Q15836 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
VAMP3Q15836 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
VAMP3Q15836 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
VAMP3Q15836 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC-1.82□□□□□ -2.7
VAMP3Q15836 snoU83B.1-201ENST00000517136 88 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
VAMP3Q15836 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
VAMP3Q15836 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
VAMP3Q15836 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
VAMP3Q15836 Y_RNA.337-201ENST00000365312 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
VAMP3Q15836 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
VAMP3Q15836 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
VAMP3Q15836 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
VAMP3Q15836 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
VAMP3Q15836 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
VAMP3Q15836 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
VAMP3Q15836 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
VAMP3Q15836 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
VAMP3Q15836 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
VAMP3Q15836 MTND5P20-201ENST00000448677 143 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
VAMP3Q15836 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC-1.84□□□□□ -2.7
VAMP3Q15836 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
VAMP3Q15836 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
VAMP3Q15836 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
VAMP3Q15836 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
VAMP3Q15836 MIR124-2-201ENST00000385081 109 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
VAMP3Q15836 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
VAMP3Q15836 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
VAMP3Q15836 RNA5SP67-201ENST00000516422 131 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
VAMP3Q15836 Y_RNA.702-201ENST00000516843 96 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
VAMP3Q15836 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
VAMP3Q15836 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
VAMP3Q15836 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
VAMP3Q15836 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
VAMP3Q15836 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
VAMP3Q15836 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
VAMP3Q15836 SNORD114-17-201ENST00000364699 75 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
VAMP3Q15836 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
VAMP3Q15836 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
VAMP3Q15836 MIRLET7B-201ENST00000385140 83 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
VAMP3Q15836 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
VAMP3Q15836 MIR759-201ENST00000390224 91 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
VAMP3Q15836 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
VAMP3Q15836 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
VAMP3Q15836 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
VAMP3Q15836 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
VAMP3Q15836 SNORA63.6-201ENST00000364921 119 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
VAMP3Q15836 Y_RNA.514-201ENST00000384528 112 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 207.7 ms