Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

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Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CKAP5Q14008 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CKAP5Q14008 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CKAP5Q14008 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CKAP5Q14008 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CKAP5Q14008 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CKAP5Q14008 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CKAP5Q14008 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CKAP5Q14008 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CKAP5Q14008 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CKAP5Q14008 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC0.77□□□□□ -2.29
CKAP5Q14008 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CKAP5Q14008 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CKAP5Q14008 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CKAP5Q14008 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CKAP5Q14008 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CKAP5Q14008 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.76□□□□□ -2.29
CKAP5Q14008 MIR548L-201ENST00000408303 86 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CKAP5Q14008 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CKAP5Q14008 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CKAP5Q14008 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CKAP5Q14008 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC0.76□□□□□ -2.29
CKAP5Q14008 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.75□□□□□ -2.29
CKAP5Q14008 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CKAP5Q14008 SNORD114-23-201ENST00000363536 72 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CKAP5Q14008 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CKAP5Q14008 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CKAP5Q14008 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CKAP5Q14008 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.75□□□□□ -2.29
CKAP5Q14008 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.75□□□□□ -2.29
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CKAP5Q14008 RNU6-640P-201ENST00000363693 105 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CKAP5Q14008 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CKAP5Q14008 AL161932.1-201ENST00000437408 146 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CKAP5Q14008 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CKAP5Q14008 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.74□□□□□ -2.29
CKAP5Q14008 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CKAP5Q14008 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CKAP5Q14008 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CKAP5Q14008 AC012531.4-201ENST00000616509 177 ntBASIC0.74□□□□□ -2.29
CKAP5Q14008 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC0.74□□□□□ -2.29
CKAP5Q14008 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CKAP5Q14008 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CKAP5Q14008 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.73□□□□□ -2.29
CKAP5Q14008 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
CKAP5Q14008 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
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CKAP5Q14008 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC0.72□□□□□ -2.29
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CKAP5Q14008 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.71□□□□□ -2.3
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CKAP5Q14008 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.71□□□□□ -2.3
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CKAP5Q14008 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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CKAP5Q14008 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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CKAP5Q14008 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.69□□□□□ -2.3
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CKAP5Q14008 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
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CKAP5Q14008 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
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CKAP5Q14008 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CKAP5Q14008 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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CKAP5Q14008 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CKAP5Q14008 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CKAP5Q14008 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CKAP5Q14008 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CKAP5Q14008 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CKAP5Q14008 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CKAP5Q14008 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CKAP5Q14008 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CKAP5Q14008 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CKAP5Q14008 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CKAP5Q14008 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
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