Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 RNU6-540P-201ENST00000384622 101 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 SNORD115-31-201ENST00000365318 82 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 RNU6-1241P-201ENST00000384536 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 RPS29P23-201ENST00000458635 123 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 RNY4P3-201ENST00000365254 95 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 RNU6-649P-201ENST00000384463 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 Y_RNA.340-201ENST00000365330 92 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 SNORD30.1-201ENST00000391309 70 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 AL135923.1-201ENST00000413066 196 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 AC125388.1-201ENST00000459631 156 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 MIR3675-201ENST00000583661 73 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 RNU6-800P-201ENST00000384473 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 U6.111-201ENST00000636093 83 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 RNU6-663P-201ENST00000391105 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
FOXE3Q13461 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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