Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 Y_RNA.386-201ENST00000383913 105 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 SNORA24B-201ENST00000384176 131 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.91□□□□□ -2.1
CLN3Q13286 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 MIR2113-201ENST00000459007 91 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 RNU6-630P-201ENST00000391258 106 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 RNU6-471P-201ENST00000383944 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 AC005520.4-201ENST00000604337 90 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
CLN3Q13286 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CLN3Q13286 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CLN3Q13286 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CLN3Q13286 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CLN3Q13286 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
CLN3Q13286 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
CLN3Q13286 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
CLN3Q13286 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CLN3Q13286 RNU6-604P-201ENST00000390917 100 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CLN3Q13286 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
CLN3Q13286 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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