Protein–RNA interactions for Protein: Q13064

MKRN3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN3Q13064 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
MKRN3Q13064 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MKRN3Q13064 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
MKRN3Q13064 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MKRN3Q13064 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
MKRN3Q13064 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
MKRN3Q13064 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
MKRN3Q13064 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
MKRN3Q13064 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MKRN3Q13064 RNU6-54P-201ENST00000365563 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MKRN3Q13064 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MKRN3Q13064 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MKRN3Q13064 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MKRN3Q13064 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MKRN3Q13064 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
MKRN3Q13064 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
MKRN3Q13064 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MKRN3Q13064 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MKRN3Q13064 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
MKRN3Q13064 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
MKRN3Q13064 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
MKRN3Q13064 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MKRN3Q13064 RNU6-656P-201ENST00000516785 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MKRN3Q13064 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
MKRN3Q13064 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
MKRN3Q13064 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MKRN3Q13064 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MKRN3Q13064 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MKRN3Q13064 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MKRN3Q13064 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
MKRN3Q13064 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
MKRN3Q13064 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
MKRN3Q13064 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
MKRN3Q13064 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
MKRN3Q13064 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
MKRN3Q13064 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
MKRN3Q13064 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MKRN3Q13064 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MKRN3Q13064 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MKRN3Q13064 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MKRN3Q13064 RNU6-1089P-201ENST00000516473 104 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MKRN3Q13064 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MKRN3Q13064 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
MKRN3Q13064 CTDSPL2-202ENST00000558373 4255 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
MKRN3Q13064 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MKRN3Q13064 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
MKRN3Q13064 RNA5SP181-201ENST00000410246 98 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MKRN3Q13064 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MKRN3Q13064 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MKRN3Q13064 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MKRN3Q13064 MIR548V-201ENST00000584165 80 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
MKRN3Q13064 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
MKRN3Q13064 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MKRN3Q13064 MIR519E-201ENST00000385075 84 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MKRN3Q13064 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MKRN3Q13064 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MKRN3Q13064 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MKRN3Q13064 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
MKRN3Q13064 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
MKRN3Q13064 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MKRN3Q13064 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MKRN3Q13064 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MKRN3Q13064 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MKRN3Q13064 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MKRN3Q13064 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC2.69□□□□□ -1.98
MKRN3Q13064 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MKRN3Q13064 RNU6-1312P-201ENST00000362425 108 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MKRN3Q13064 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MKRN3Q13064 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MKRN3Q13064 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MKRN3Q13064 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MKRN3Q13064 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MKRN3Q13064 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MKRN3Q13064 MIR5694-201ENST00000581190 76 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MKRN3Q13064 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
MKRN3Q13064 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MKRN3Q13064 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MKRN3Q13064 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MKRN3Q13064 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.67□□□□□ -1.98
MKRN3Q13064 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MKRN3Q13064 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
MKRN3Q13064 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MKRN3Q13064 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
MKRN3Q13064 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
MKRN3Q13064 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
MKRN3Q13064 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
MKRN3Q13064 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
MKRN3Q13064 XPO4-202ENST00000400602 9884 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
MKRN3Q13064 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.65□□□□□ -1.98
MKRN3Q13064 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
MKRN3Q13064 RNU7-104P-201ENST00000459398 79 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
MKRN3Q13064 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.65□□□□□ -1.99
MKRN3Q13064 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
MKRN3Q13064 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
MKRN3Q13064 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC2.64□□□□□ -1.99
MKRN3Q13064 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.64□□□□□ -1.99
MKRN3Q13064 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
MKRN3Q13064 MIR630-201ENST00000384957 97 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
MKRN3Q13064 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
MKRN3Q13064 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
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