Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
PTPRMP28827 AC084782.3-201ENST00000612282 578 ntBASIC-2.19□□□□□ -2.76
PTPRMP28827 TARS-215ENST00000626210 201 ntTSL 5 BASIC-2.19□□□□□ -2.76
PTPRMP28827 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
PTPRMP28827 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
PTPRMP28827 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
PTPRMP28827 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC-2.2□□□□□ -2.76
PTPRMP28827 Y_RNA.400-201ENST00000383963 111 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
PTPRMP28827 RNU6-400P-201ENST00000391173 106 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
PTPRMP28827 AL353691.2-201ENST00000443795 59 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
PTPRMP28827 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
PTPRMP28827 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
PTPRMP28827 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
PTPRMP28827 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-2.2□□□□□ -2.76
PTPRMP28827 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
PTPRMP28827 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
PTPRMP28827 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
PTPRMP28827 MTND3P3-201ENST00000505004 126 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
PTPRMP28827 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
PTPRMP28827 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
PTPRMP28827 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
PTPRMP28827 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC-2.21□□□□□ -2.76
PTPRMP28827 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC-2.21□□□□□ -2.76
PTPRMP28827 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
PTPRMP28827 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
PTPRMP28827 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
PTPRMP28827 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
PTPRMP28827 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
PTPRMP28827 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
PTPRMP28827 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC-2.22□□□□□ -2.77
PTPRMP28827 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
PTPRMP28827 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
PTPRMP28827 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
PTPRMP28827 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
PTPRMP28827 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-2.23□□□□□ -2.77
PTPRMP28827 UBL4A-207ENST00000630530 102 ntTSL 5 BASIC-2.23□□□□□ -2.77
PTPRMP28827 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
PTPRMP28827 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
PTPRMP28827 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
PTPRMP28827 Y_RNA.613-201ENST00000410726 97 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
PTPRMP28827 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
PTPRMP28827 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
PTPRMP28827 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
PTPRMP28827 RNU6-168P-201ENST00000516189 101 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
PTPRMP28827 RNU6-1046P-201ENST00000516538 107 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
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PTPRMP28827 MIR4490-201ENST00000582647 84 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
PTPRMP28827 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
PTPRMP28827 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC-2.24□□□□□ -2.77
PTPRMP28827 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
PTPRMP28827 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
PTPRMP28827 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
PTPRMP28827 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC-2.25□□□□□ -2.77
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PTPRMP28827 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
PTPRMP28827 Y_RNA.348-201ENST00000365403 103 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
PTPRMP28827 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
PTPRMP28827 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
PTPRMP28827 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
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PTPRMP28827 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC-2.26□□□□□ -2.77
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PTPRMP28827 Y_RNA.581-201ENST00000391017 97 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
PTPRMP28827 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
PTPRMP28827 Y_RNA.591-201ENST00000410228 104 ntBASIC-2.28□□□□□ -2.77
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PTPRMP28827 RNU4-88P-201ENST00000411220 86 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
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PTPRMP28827 RNU6-1191P-201ENST00000516799 107 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
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PTPRMP28827 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-2.31□□□□□ -2.78
PTPRMP28827 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
PTPRMP28827 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
PTPRMP28827 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
PTPRMP28827 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.32□□□□□ -2.78
PTPRMP28827 RNU6-79P-201ENST00000362511 107 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
PTPRMP28827 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
PTPRMP28827 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
PTPRMP28827 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC-2.33□□□□□ -2.78
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