Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SOBPA7XYQ1 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SOBPA7XYQ1 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SOBPA7XYQ1 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SOBPA7XYQ1 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SOBPA7XYQ1 SCARNA21.1-201ENST00000515996 128 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SOBPA7XYQ1 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SOBPA7XYQ1 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SOBPA7XYQ1 MIR7978-201ENST00000636158 59 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SOBPA7XYQ1 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SOBPA7XYQ1 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SOBPA7XYQ1 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SOBPA7XYQ1 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SOBPA7XYQ1 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SOBPA7XYQ1 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SOBPA7XYQ1 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SOBPA7XYQ1 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SOBPA7XYQ1 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SOBPA7XYQ1 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SOBPA7XYQ1 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SOBPA7XYQ1 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.22□□□□□ -2.05
SOBPA7XYQ1 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SOBPA7XYQ1 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SOBPA7XYQ1 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
SOBPA7XYQ1 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SOBPA7XYQ1 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SOBPA7XYQ1 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SOBPA7XYQ1 RNU6-1184P-201ENST00000384588 108 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SOBPA7XYQ1 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SOBPA7XYQ1 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
SOBPA7XYQ1 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SOBPA7XYQ1 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SOBPA7XYQ1 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SOBPA7XYQ1 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SOBPA7XYQ1 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SOBPA7XYQ1 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SOBPA7XYQ1 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SOBPA7XYQ1 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
SOBPA7XYQ1 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.2□□□□□ -2.06
SOBPA7XYQ1 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SOBPA7XYQ1 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
SOBPA7XYQ1 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SOBPA7XYQ1 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SOBPA7XYQ1 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC2.19□□□□□ -2.06
SOBPA7XYQ1 RNU6-122P-201ENST00000516818 107 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SOBPA7XYQ1 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SOBPA7XYQ1 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.19□□□□□ -2.06
SOBPA7XYQ1 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SOBPA7XYQ1 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SOBPA7XYQ1 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SOBPA7XYQ1 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SOBPA7XYQ1 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SOBPA7XYQ1 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SOBPA7XYQ1 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SOBPA7XYQ1 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SOBPA7XYQ1 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SOBPA7XYQ1 MIR3938-201ENST00000582157 103 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
SOBPA7XYQ1 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
SOBPA7XYQ1 SNORD113-4-201ENST00000364802 75 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SOBPA7XYQ1 TRAJ9-201ENST00000390528 61 ntAPPRIS P1 BASIC2.16□□□□□ -2.06
SOBPA7XYQ1 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SOBPA7XYQ1 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
SOBPA7XYQ1 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
SOBPA7XYQ1 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
SOBPA7XYQ1 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
SOBPA7XYQ1 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
SOBPA7XYQ1 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
SOBPA7XYQ1 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SOBPA7XYQ1 RNU6-936P-201ENST00000384005 107 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SOBPA7XYQ1 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SOBPA7XYQ1 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SOBPA7XYQ1 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SOBPA7XYQ1 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SOBPA7XYQ1 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SOBPA7XYQ1 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SOBPA7XYQ1 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SOBPA7XYQ1 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SOBPA7XYQ1 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SOBPA7XYQ1 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SOBPA7XYQ1 RNU6-1126P-201ENST00000384002 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SOBPA7XYQ1 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SOBPA7XYQ1 SNORD23.1-201ENST00000408212 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SOBPA7XYQ1 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SOBPA7XYQ1 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SOBPA7XYQ1 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SOBPA7XYQ1 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SOBPA7XYQ1 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SOBPA7XYQ1 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SOBPA7XYQ1 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SOBPA7XYQ1 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SOBPA7XYQ1 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SOBPA7XYQ1 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SOBPA7XYQ1 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SOBPA7XYQ1 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SOBPA7XYQ1 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SOBPA7XYQ1 MIR5002-201ENST00000584713 97 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SOBPA7XYQ1 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SOBPA7XYQ1 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SOBPA7XYQ1 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
SOBPA7XYQ1 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
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