Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

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Length 406 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.448-201ENST00000384185 108 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 U8.15-201ENST00000390947 134 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.620-201ENST00000411009 88 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 MIR6788-201ENST00000618842 66 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 HSBP1P2-201ENST00000299671 229 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 SNORD114-10-201ENST00000363409 72 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-820P-201ENST00000384273 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 RNU6ATAC42P-201ENST00000408637 95 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
HERPUD2Q9BSE4 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-949P-201ENST00000384040 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 RNA5SP225-201ENST00000410874 135 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 AC022137.1-201ENST00000483735 151 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.82□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 SNORD45B-201ENST00000364617 72 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 RNU7-48P-201ENST00000458875 63 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 MIR5588-201ENST00000581890 63 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
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HERPUD2Q9BSE4 RNU6-42P-201ENST00000384165 107 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
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HERPUD2Q9BSE4 MIR548J-201ENST00000408833 112 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 snoU13.18-201ENST00000459483 104 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
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HERPUD2Q9BSE4 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
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HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC0.8□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 CYP3A137P-201ENST00000562436 69 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-633P-201ENST00000362612 103 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.94-201ENST00000363068 106 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1125P-201ENST00000363601 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
HERPUD2Q9BSE4 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
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