Protein–RNA interactions for Protein: Q99990

VGLL1, Transcription cofactor vestigial-like protein 1, humanhuman

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Length 258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGLL1Q99990 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 MIR6857-201ENST00000613267 93 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 Y_RNA.107-201ENST00000363190 121 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.63□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 RNU6ATAC27P-201ENST00000408289 119 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 MIR4698-201ENST00000577795 80 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.61□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 MIR18A-201ENST00000362310 71 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 RNU6-1298P-201ENST00000362456 101 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 ACA64.5-201ENST00000516207 127 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 Y_RNA.677-201ENST00000516401 85 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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VGLL1Q99990 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
VGLL1Q99990 AL138808.1-201ENST00000441428 371 ntTSL 2 BASIC0.59□□□□□ -2.31
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VGLL1Q99990 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
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VGLL1Q99990 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
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VGLL1Q99990 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
VGLL1Q99990 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
VGLL1Q99990 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
VGLL1Q99990 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
VGLL1Q99990 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
VGLL1Q99990 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
VGLL1Q99990 RNA5SP403-201ENST00000363598 108 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
VGLL1Q99990 Y_RNA.190-201ENST00000363964 101 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
VGLL1Q99990 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
VGLL1Q99990 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
VGLL1Q99990 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
VGLL1Q99990 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
VGLL1Q99990 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
VGLL1Q99990 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
VGLL1Q99990 RNU7-161P-201ENST00000517289 62 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
VGLL1Q99990 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
VGLL1Q99990 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
VGLL1Q99990 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.56□□□□□ -2.32
VGLL1Q99990 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
VGLL1Q99990 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
VGLL1Q99990 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
VGLL1Q99990 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
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