Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 AC243829.3-201ENST00000622177 108 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.31
TRAPPC9Q96Q05 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.59□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.155-201ENST00000363632 101 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 AC010487.4-201ENST00000637027 61 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 AC098934.3-201ENST00000430450 190 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 MIR4711-201ENST00000578274 70 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC0.56□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 AL512310.12-203ENST00000640543 90 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP193-201ENST00000410353 107 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC0.55□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-229P-201ENST00000516614 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.54□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC0.53□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-589P-201ENST00000516485 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 MIR924-201ENST00000638017 53 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.30-201ENST00000362572 97 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC0.52□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 SNORA8.2-201ENST00000384372 139 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 MIR518A1-201ENST00000385068 85 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 MIR3613-201ENST00000579844 87 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
TRAPPC9Q96Q05 SNORA68.3-201ENST00000515906 83 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169.6 ms