Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ3

USP30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP30Q70CQ3 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 RNU6-979P-201ENST00000383896 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 RNU6-519P-201ENST00000410590 108 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 RNU6-1276P-201ENST00000365372 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 RNU6-242P-201ENST00000384359 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
USP30Q70CQ3 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
USP30Q70CQ3 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP30Q70CQ3 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP30Q70CQ3 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP30Q70CQ3 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP30Q70CQ3 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP30Q70CQ3 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP30Q70CQ3 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP30Q70CQ3 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP30Q70CQ3 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP30Q70CQ3 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
USP30Q70CQ3 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.26□□□□□ -2.21
USP30Q70CQ3 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP30Q70CQ3 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP30Q70CQ3 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP30Q70CQ3 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP30Q70CQ3 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
USP30Q70CQ3 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
USP30Q70CQ3 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP30Q70CQ3 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP30Q70CQ3 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP30Q70CQ3 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP30Q70CQ3 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP30Q70CQ3 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP30Q70CQ3 RNU7-153P-201ENST00000516455 62 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP30Q70CQ3 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
USP30Q70CQ3 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.25□□□□□ -2.21
USP30Q70CQ3 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
USP30Q70CQ3 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP30Q70CQ3 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP30Q70CQ3 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP30Q70CQ3 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
USP30Q70CQ3 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP30Q70CQ3 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP30Q70CQ3 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP30Q70CQ3 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP30Q70CQ3 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
USP30Q70CQ3 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USP30Q70CQ3 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.23□□□□□ -2.21
USP30Q70CQ3 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USP30Q70CQ3 MIR1255A-201ENST00000408338 113 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
USP30Q70CQ3 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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