Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 AC106800.4-201ENST00000614905 153 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 MIRLET7A1-201ENST00000362295 80 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 RNU6-686P-201ENST00000364839 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 MIR518E-201ENST00000385252 88 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 UBE3A-225ENST00000636667 5726 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 ZNF355P-201ENST00000427301 3216 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 RNU6-557P-201ENST00000516842 110 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 FAS-AS1.1-201ENST00000615327 126 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 RNU6-208P-201ENST00000362431 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 SNORD77.2-201ENST00000391045 68 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 Y_RNA.532-201ENST00000384590 113 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 RNU6-380P-201ENST00000410207 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 MIR3134-201ENST00000579433 74 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
HIF1AQ16665 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
HIF1AQ16665 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
HIF1AQ16665 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
HIF1AQ16665 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HIF1AQ16665 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HIF1AQ16665 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HIF1AQ16665 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HIF1AQ16665 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
HIF1AQ16665 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
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HIF1AQ16665 Y_RNA.545-201ENST00000384652 105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HIF1AQ16665 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HIF1AQ16665 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HIF1AQ16665 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HIF1AQ16665 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HIF1AQ16665 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HIF1AQ16665 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
HIF1AQ16665 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HIF1AQ16665 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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HIF1AQ16665 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
HIF1AQ16665 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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HIF1AQ16665 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
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HIF1AQ16665 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
HIF1AQ16665 MIR664A-201ENST00000626086 82 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
HIF1AQ16665 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HIF1AQ16665 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HIF1AQ16665 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HIF1AQ16665 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HIF1AQ16665 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HIF1AQ16665 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
HIF1AQ16665 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HIF1AQ16665 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
HIF1AQ16665 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
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