Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

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Length 413 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
E2F4Q16254 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
E2F4Q16254 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
E2F4Q16254 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
E2F4Q16254 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
E2F4Q16254 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
E2F4Q16254 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
E2F4Q16254 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
E2F4Q16254 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
E2F4Q16254 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
E2F4Q16254 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
E2F4Q16254 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
E2F4Q16254 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.37□□□□□ -2.03
E2F4Q16254 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
E2F4Q16254 SNORD79.1-201ENST00000516069 84 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
E2F4Q16254 RNU6-1015P-201ENST00000517121 99 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
E2F4Q16254 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
E2F4Q16254 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
E2F4Q16254 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
E2F4Q16254 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
E2F4Q16254 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
E2F4Q16254 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
E2F4Q16254 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
E2F4Q16254 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
E2F4Q16254 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
E2F4Q16254 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
E2F4Q16254 RNU6ATAC8P-201ENST00000408460 126 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
E2F4Q16254 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
E2F4Q16254 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
E2F4Q16254 AC008413.1-201ENST00000511864 177 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
E2F4Q16254 RNU6-1057P-201ENST00000517162 102 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
E2F4Q16254 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
E2F4Q16254 RNU6-681P-201ENST00000364012 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
E2F4Q16254 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
E2F4Q16254 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
E2F4Q16254 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
E2F4Q16254 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
E2F4Q16254 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
E2F4Q16254 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
E2F4Q16254 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
E2F4Q16254 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
E2F4Q16254 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
E2F4Q16254 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
E2F4Q16254 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
E2F4Q16254 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
E2F4Q16254 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
E2F4Q16254 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
E2F4Q16254 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
E2F4Q16254 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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E2F4Q16254 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
E2F4Q16254 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
E2F4Q16254 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
E2F4Q16254 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
E2F4Q16254 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
E2F4Q16254 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
E2F4Q16254 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
E2F4Q16254 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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E2F4Q16254 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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E2F4Q16254 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
E2F4Q16254 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
E2F4Q16254 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
E2F4Q16254 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
E2F4Q16254 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
E2F4Q16254 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
E2F4Q16254 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
E2F4Q16254 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
E2F4Q16254 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
E2F4Q16254 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
E2F4Q16254 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
E2F4Q16254 TRAJ30-201ENST00000390507 57 ntAPPRIS P1 BASIC2.27□□□□□ -2.05
E2F4Q16254 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
E2F4Q16254 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
E2F4Q16254 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
E2F4Q16254 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
E2F4Q16254 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
E2F4Q16254 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
E2F4Q16254 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
E2F4Q16254 Y_RNA.606-201ENST00000410579 103 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
E2F4Q16254 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
E2F4Q16254 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
E2F4Q16254 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
E2F4Q16254 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
E2F4Q16254 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
E2F4Q16254 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
E2F4Q16254 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
E2F4Q16254 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
E2F4Q16254 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
E2F4Q16254 RNU7-13P-201ENST00000516413 62 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
E2F4Q16254 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
E2F4Q16254 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
E2F4Q16254 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
E2F4Q16254 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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