Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
GRIK4Q16099 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GRIK4Q16099 TRAJ37-201ENST00000612375 65 ntAPPRIS P1 BASIC2.09□□□□□ -2.07
GRIK4Q16099 U6.81-201ENST00000612550 106 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GRIK4Q16099 MIR8053-201ENST00000613344 75 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GRIK4Q16099 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GRIK4Q16099 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
GRIK4Q16099 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 SNORD45A-201ENST00000384512 84 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 RNU6-824P-201ENST00000363724 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 RNU6-895P-201ENST00000384125 103 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 AC055731.1-201ENST00000474387 401 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 MIR4511-201ENST00000582784 87 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 SNORD45.1-201ENST00000363181 77 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 RNU6-669P-201ENST00000365575 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
GRIK4Q16099 RNU6-1216P-201ENST00000362590 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 SNORD113.1-201ENST00000363280 73 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 AL096840.1-201ENST00000603287 93 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.01□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC2□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 C9orf84-205ENST00000394779 5060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 SNORA16.1-201ENST00000364597 132 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 DLEU2_3.2-201ENST00000612883 73 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
GRIK4Q16099 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 205 ms