Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 RNU2-51P-201ENST00000410708 197 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 RNA5SP180-201ENST00000516181 101 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 hsa-mir-3119-1.1-201ENST00000577602 85 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 MIR4520-1-201ENST00000582609 70 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 Y_RNA.468-201ENST00000384298 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 SNORD116-6-201ENST00000384711 96 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 RNU6-576P-201ENST00000390854 102 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 Y_RNA.390-201ENST00000383932 102 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 AL353803.5-201ENST00000599815 141 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
NEDD8Q15843 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 SNORD115-33-201ENST00000363723 82 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 AL353795.2-201ENST00000431804 425 ntTSL 2 BASIC-1.85□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 SNORD63.1-201ENST00000516178 80 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 SNORA26.4-201ENST00000391188 123 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 AC090617.8-201ENST00000623339 167 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 MTND3P22-201ENST00000510932 243 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 MIR1302-2-201ENST00000607096 138 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 MIR1246-201ENST00000636535 73 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 Y_RNA.68-201ENST00000362881 102 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 AC069439.1-201ENST00000494739 167 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC-1.89□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 Y_RNA.232-201ENST00000364369 96 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 Y_RNA.279-201ENST00000364763 95 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
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NEDD8Q15843 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
NEDD8Q15843 RNA5SP26-201ENST00000362406 119 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
NEDD8Q15843 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
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