Protein–RNA interactions for Protein: Q15437

SEC23B, Protein transport protein Sec23B, humanhuman

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Length 767 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23BQ15437 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
SEC23BQ15437 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SEC23BQ15437 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SEC23BQ15437 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SEC23BQ15437 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SEC23BQ15437 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SEC23BQ15437 AC211469.2-201ENST00000605461 205 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SEC23BQ15437 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
SEC23BQ15437 CCDC14-221ENST00000489746 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
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SEC23BQ15437 RNU4-38P-201ENST00000364472 129 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SEC23BQ15437 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SEC23BQ15437 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SEC23BQ15437 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SEC23BQ15437 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SEC23BQ15437 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SEC23BQ15437 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SEC23BQ15437 MIR548Z-201ENST00000584743 97 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
SEC23BQ15437 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SEC23BQ15437 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SEC23BQ15437 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SEC23BQ15437 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SEC23BQ15437 RNU4ATAC11P-201ENST00000515939 126 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
SEC23BQ15437 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SEC23BQ15437 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SEC23BQ15437 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SEC23BQ15437 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SEC23BQ15437 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SEC23BQ15437 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC0.89□□□□□ -2.27
SEC23BQ15437 SNORD116-10-201ENST00000363791 102 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SEC23BQ15437 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.88□□□□□ -2.27
SEC23BQ15437 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SEC23BQ15437 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC0.88□□□□□ -2.27
SEC23BQ15437 MIR573-201ENST00000384964 99 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SEC23BQ15437 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SEC23BQ15437 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SEC23BQ15437 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SEC23BQ15437 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SEC23BQ15437 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SEC23BQ15437 PSMC1P5-201ENST00000512850 177 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SEC23BQ15437 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SEC23BQ15437 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SEC23BQ15437 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SEC23BQ15437 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SEC23BQ15437 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
SEC23BQ15437 Y_RNA.220-201ENST00000364244 109 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SEC23BQ15437 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SEC23BQ15437 RNU4-45P-201ENST00000365469 141 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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SEC23BQ15437 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SEC23BQ15437 AC244505.6-201ENST00000452829 130 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
SEC23BQ15437 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
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SEC23BQ15437 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SEC23BQ15437 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SEC23BQ15437 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
SEC23BQ15437 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SEC23BQ15437 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SEC23BQ15437 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SEC23BQ15437 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SEC23BQ15437 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SEC23BQ15437 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
SEC23BQ15437 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
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SEC23BQ15437 MIR1276-201ENST00000408707 83 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SEC23BQ15437 Y_RNA.648-201ENST00000459455 110 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SEC23BQ15437 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SEC23BQ15437 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SEC23BQ15437 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SEC23BQ15437 MIR6504-201ENST00000613520 61 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
SEC23BQ15437 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.83□□□□□ -2.28
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SEC23BQ15437 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SEC23BQ15437 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SEC23BQ15437 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SEC23BQ15437 MIR3612-201ENST00000579753 87 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
SEC23BQ15437 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
SEC23BQ15437 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.81□□□□□ -2.28
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SEC23BQ15437 TEX15-201ENST00000256246 10110 ntTSL 1 (best) BASIC0.8□□□□□ -2.28
SEC23BQ15437 Y_RNA.43-201ENST00000362670 111 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SEC23BQ15437 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SEC23BQ15437 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SEC23BQ15437 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SEC23BQ15437 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SEC23BQ15437 MIR4653-201ENST00000585107 83 ntBASIC0.8□□□□□ -2.28
SEC23BQ15437 FAM19A1-204ENST00000617084 159 ntTSL 5 BASIC0.8□□□□□ -2.28
SEC23BQ15437 Y_RNA.191-201ENST00000363972 113 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SEC23BQ15437 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SEC23BQ15437 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SEC23BQ15437 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SEC23BQ15437 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SEC23BQ15437 RNU6-844P-201ENST00000517175 102 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SEC23BQ15437 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC0.79□□□□□ -2.28
SEC23BQ15437 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.78□□□□□ -2.28
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