Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 Y_RNA.299-201ENST00000364973 94 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 SNORA40.15-201ENST00000516884 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 FGF7P6-202ENST00000451282 293 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 RNU6-1157P-201ENST00000384456 106 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 RNU7-2P-201ENST00000516096 62 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 AC087741.2-201ENST00000619415 172 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC-1.53□□□□□ -2.65
SYCP1Q15431 RNU6-905P-201ENST00000384434 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SYCP1Q15431 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SYCP1Q15431 MIR516A2-201ENST00000384888 90 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SYCP1Q15431 MIR516A1-201ENST00000385033 90 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SYCP1Q15431 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SYCP1Q15431 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
SYCP1Q15431 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC-1.54□□□□□ -2.66
SYCP1Q15431 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SYCP1Q15431 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SYCP1Q15431 Y_RNA.228-201ENST00000364346 98 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SYCP1Q15431 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SYCP1Q15431 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SYCP1Q15431 Y_RNA.596-201ENST00000410462 109 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SYCP1Q15431 Evf-2_5p.1-201ENST00000614213 142 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SYCP1Q15431 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC-1.55□□□□□ -2.66
SYCP1Q15431 SNORD115-23-201ENST00000364461 82 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SYCP1Q15431 RNU6-450P-201ENST00000364654 107 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SYCP1Q15431 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SYCP1Q15431 AC092755.1-201ENST00000441746 97 ntTSL 3 BASIC-1.56□□□□□ -2.66
SYCP1Q15431 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC-1.56□□□□□ -2.66
SYCP1Q15431 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SYCP1Q15431 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SYCP1Q15431 Y_RNA.645-201ENST00000391229 102 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SYCP1Q15431 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SYCP1Q15431 RNY3P15-201ENST00000516297 97 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SYCP1Q15431 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SYCP1Q15431 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SYCP1Q15431 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SYCP1Q15431 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-1.57□□□□□ -2.66
SYCP1Q15431 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SYCP1Q15431 Y_RNA.377-201ENST00000365644 108 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SYCP1Q15431 Y_RNA.601-201ENST00000410500 113 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SYCP1Q15431 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SYCP1Q15431 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-1.58□□□□□ -2.66
SYCP1Q15431 Y_RNA.19-201ENST00000362462 99 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SYCP1Q15431 Y_RNA.315-201ENST00000365117 102 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SYCP1Q15431 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SYCP1Q15431 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SYCP1Q15431 SNORD116-4-201ENST00000384733 96 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SYCP1Q15431 MIR216B-201ENST00000390186 82 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SYCP1Q15431 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SYCP1Q15431 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SYCP1Q15431 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-1.59□□□□□ -2.66
SYCP1Q15431 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 Y_RNA.150-201ENST00000363562 102 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-1.6□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
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SYCP1Q15431 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC-1.61□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC-1.62□□□□□ -2.67
SYCP1Q15431 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-1.63□□□□□ -2.67
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