Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 MTND2P14-201ENST00000482139 351 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-2.86□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 Y_RNA.772-201ENST00000606692 102 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC-2.86□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-2.87□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 RNU6-690P-201ENST00000365242 106 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 MIR4528-201ENST00000577763 90 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 MIR466-201ENST00000580653 84 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC-2.88□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 Y_RNA.313-201ENST00000365095 103 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC-2.89□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-2.9□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 Y_RNA.566-201ENST00000384735 101 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 Y_RNA.584-201ENST00000391090 114 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 MIR4748-201ENST00000578076 82 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC-2.91□□□□□ -2.87
SHPRHQ149N8 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SHPRHQ149N8 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SHPRHQ149N8 MIR23C-201ENST00000579846 100 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SHPRHQ149N8 C8orf59P2-201ENST00000603441 271 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SHPRHQ149N8 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SHPRHQ149N8 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SHPRHQ149N8 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SHPRHQ149N8 AL356475.1-201ENST00000440321 341 ntTSL 5 BASIC-2.92□□□□□ -2.88
SHPRHQ149N8 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SHPRHQ149N8 IGHVII-40-1-201ENST00000517316 58 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SHPRHQ149N8 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC-2.92□□□□□ -2.88
SHPRHQ149N8 RNU6-616P-201ENST00000384353 107 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
SHPRHQ149N8 MIR34C-201ENST00000384831 77 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
SHPRHQ149N8 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-2.93□□□□□ -2.88
SHPRHQ149N8 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
SHPRHQ149N8 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
SHPRHQ149N8 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-2.94□□□□□ -2.88
SHPRHQ149N8 RNU6-593P-201ENST00000364716 112 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
SHPRHQ149N8 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
SHPRHQ149N8 SEPT14P3-201ENST00000439401 183 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
SHPRHQ149N8 AL732372.2-207ENST00000445840 183 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
SHPRHQ149N8 SEPT14P2-201ENST00000453405 183 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
SHPRHQ149N8 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
SHPRHQ149N8 Y_RNA.708-201ENST00000516950 96 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
SHPRHQ149N8 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
SHPRHQ149N8 FO082796.1-201ENST00000523795 183 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
SHPRHQ149N8 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
SHPRHQ149N8 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
SHPRHQ149N8 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
SHPRHQ149N8 RNU7-164P-201ENST00000459221 62 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
SHPRHQ149N8 RNU7-123P-201ENST00000515911 60 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
SHPRHQ149N8 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-2.95□□□□□ -2.88
SHPRHQ149N8 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
SHPRHQ149N8 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
SHPRHQ149N8 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
SHPRHQ149N8 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC-2.96□□□□□ -2.88
SHPRHQ149N8 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
SHPRHQ149N8 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
SHPRHQ149N8 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
SHPRHQ149N8 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
SHPRHQ149N8 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
SHPRHQ149N8 MIR3915-201ENST00000578518 97 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
SHPRHQ149N8 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC-2.97□□□□□ -2.88
SHPRHQ149N8 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC-2.97□□□□□ -2.88
SHPRHQ149N8 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
SHPRHQ149N8 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
SHPRHQ149N8 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
SHPRHQ149N8 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC-2.98□□□□□ -2.89
SHPRHQ149N8 RNU6-1213P-201ENST00000517075 94 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
SHPRHQ149N8 Y_RNA.501-201ENST00000384467 103 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
SHPRHQ149N8 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
SHPRHQ149N8 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
SHPRHQ149N8 FGF7P7-201ENST00000514120 227 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
SHPRHQ149N8 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC-2.98□□□□□ -2.89
SHPRHQ149N8 RNU6-937P-201ENST00000384325 106 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
SHPRHQ149N8 MIR513B-201ENST00000385136 84 ntBASIC-2.99□□□□□ -2.89
SHPRHQ149N8 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
SHPRHQ149N8 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
SHPRHQ149N8 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
SHPRHQ149N8 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
SHPRHQ149N8 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
SHPRHQ149N8 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-3□□□□□ -2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 172.7 ms