Protein–RNA interactions for Protein: Q14938

NFIX, Nuclear factor 1 X-type, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIXQ14938 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
NFIXQ14938 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
NFIXQ14938 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
NFIXQ14938 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
NFIXQ14938 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
NFIXQ14938 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NFIXQ14938 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NFIXQ14938 MIR154-201ENST00000385243 84 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NFIXQ14938 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NFIXQ14938 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NFIXQ14938 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NFIXQ14938 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NFIXQ14938 AL353770.2-201ENST00000620024 78 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
NFIXQ14938 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
NFIXQ14938 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NFIXQ14938 Y_RNA.264-201ENST00000364665 102 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NFIXQ14938 RNU6-154P-201ENST00000384306 106 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NFIXQ14938 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NFIXQ14938 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NFIXQ14938 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NFIXQ14938 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
NFIXQ14938 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
NFIXQ14938 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NFIXQ14938 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NFIXQ14938 RNU6-1254P-201ENST00000391266 104 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NFIXQ14938 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NFIXQ14938 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NFIXQ14938 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NFIXQ14938 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
NFIXQ14938 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NFIXQ14938 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NFIXQ14938 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
NFIXQ14938 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NFIXQ14938 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NFIXQ14938 AL606490.4-201ENST00000423117 127 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NFIXQ14938 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
NFIXQ14938 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
NFIXQ14938 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
NFIXQ14938 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NFIXQ14938 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NFIXQ14938 TRAJ53-201ENST00000390485 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.84□□□□□ -2.11
NFIXQ14938 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NFIXQ14938 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NFIXQ14938 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
NFIXQ14938 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.12
NFIXQ14938 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NFIXQ14938 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
NFIXQ14938 MIR96-201ENST00000362288 78 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NFIXQ14938 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NFIXQ14938 RNU6-499P-201ENST00000365615 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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NFIXQ14938 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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NFIXQ14938 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NFIXQ14938 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
NFIXQ14938 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
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NFIXQ14938 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NFIXQ14938 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NFIXQ14938 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NFIXQ14938 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NFIXQ14938 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NFIXQ14938 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NFIXQ14938 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
NFIXQ14938 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
NFIXQ14938 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.81□□□□□ -2.12
NFIXQ14938 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
NFIXQ14938 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NFIXQ14938 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NFIXQ14938 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NFIXQ14938 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NFIXQ14938 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NFIXQ14938 SNORD116-24-201ENST00000384549 92 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NFIXQ14938 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NFIXQ14938 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NFIXQ14938 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NFIXQ14938 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NFIXQ14938 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NFIXQ14938 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NFIXQ14938 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NFIXQ14938 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
NFIXQ14938 SNORD115-22-201ENST00000364456 82 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NFIXQ14938 Y_RNA.443-201ENST00000384135 111 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NFIXQ14938 AC093423.1-201ENST00000440817 142 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NFIXQ14938 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NFIXQ14938 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NFIXQ14938 AC007991.3-201ENST00000517623 502 ntTSL 4 BASIC1.78□□□□□ -2.12
NFIXQ14938 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NFIXQ14938 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NFIXQ14938 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NFIXQ14938 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.13
NFIXQ14938 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
NFIXQ14938 RNU6-141P-201ENST00000410499 105 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NFIXQ14938 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
NFIXQ14938 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
NFIXQ14938 SNORA25.4-201ENST00000363666 124 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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