Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CHD4Q14839 MIR6828-201ENST00000636181 60 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
CHD4Q14839 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CHD4Q14839 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CHD4Q14839 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CHD4Q14839 MIR548AE2-201ENST00000583456 67 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CHD4Q14839 RNA5SP517-201ENST00000364724 117 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CHD4Q14839 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CHD4Q14839 SNORD77B-201ENST00000391112 67 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CHD4Q14839 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CHD4Q14839 AC069113.3-201ENST00000521019 150 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CHD4Q14839 MIR376B-201ENST00000614515 100 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
CHD4Q14839 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CHD4Q14839 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CHD4Q14839 Y_RNA.213-201ENST00000364178 111 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CHD4Q14839 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CHD4Q14839 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CHD4Q14839 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CHD4Q14839 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
CHD4Q14839 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC0.2□□□□□ -2.38
CHD4Q14839 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CHD4Q14839 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CHD4Q14839 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CHD4Q14839 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CHD4Q14839 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CHD4Q14839 MIR617-201ENST00000385030 97 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CHD4Q14839 MIR3163-201ENST00000581592 73 ntBASIC0.19□□□□□ -2.38
CHD4Q14839 RNU6-363P-201ENST00000362895 105 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CHD4Q14839 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CHD4Q14839 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CHD4Q14839 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC0.18□□□□□ -2.38
CHD4Q14839 RNU6-1163P-201ENST00000364516 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
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CHD4Q14839 Y_RNA.323-201ENST00000365157 109 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CHD4Q14839 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CHD4Q14839 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CHD4Q14839 MIR601-201ENST00000385256 79 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CHD4Q14839 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC0.17□□□□□ -2.38
CHD4Q14839 Y_RNA.127-201ENST00000363386 109 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CHD4Q14839 Y_RNA.215-201ENST00000364204 112 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CHD4Q14839 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CHD4Q14839 Y_RNA.528-201ENST00000384575 108 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
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CHD4Q14839 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CHD4Q14839 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CHD4Q14839 MIR4743-201ENST00000584576 69 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CHD4Q14839 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
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CHD4Q14839 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
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CHD4Q14839 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 uc_338.28-201ENST00000612082 187 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 MIR1255B1-201ENST00000636325 63 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 C9orf84-203ENST00000374287 4721 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC0.13□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 AC007012.1-201ENST00000567192 175 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 Y_RNA.218-201ENST00000364218 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CHD4Q14839 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
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