Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SCARF1Q14162 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCARF1Q14162 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCARF1Q14162 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCARF1Q14162 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCARF1Q14162 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCARF1Q14162 snoU13.21-201ENST00000459368 105 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SCARF1Q14162 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SCARF1Q14162 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCARF1Q14162 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCARF1Q14162 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCARF1Q14162 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCARF1Q14162 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCARF1Q14162 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SCARF1Q14162 RNU6-829P-201ENST00000363700 112 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCARF1Q14162 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCARF1Q14162 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCARF1Q14162 RNU6-717P-201ENST00000459076 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCARF1Q14162 RNU6-982P-201ENST00000516216 102 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCARF1Q14162 MIR4773-1-201ENST00000637203 78 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCARF1Q14162 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SCARF1Q14162 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SCARF1Q14162 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
SCARF1Q14162 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCARF1Q14162 RNU6-382P-201ENST00000365181 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCARF1Q14162 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCARF1Q14162 RNU7-185P-201ENST00000459215 60 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCARF1Q14162 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCARF1Q14162 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCARF1Q14162 AC069503.3-201ENST00000618674 145 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SCARF1Q14162 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SCARF1Q14162 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SCARF1Q14162 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SCARF1Q14162 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SCARF1Q14162 RNU6-250P-201ENST00000516958 103 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SCARF1Q14162 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SCARF1Q14162 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
SCARF1Q14162 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCARF1Q14162 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCARF1Q14162 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCARF1Q14162 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCARF1Q14162 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCARF1Q14162 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SCARF1Q14162 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SCARF1Q14162 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SCARF1Q14162 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SCARF1Q14162 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SCARF1Q14162 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SCARF1Q14162 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCARF1Q14162 SNORA6-201ENST00000384033 151 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCARF1Q14162 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCARF1Q14162 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCARF1Q14162 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCARF1Q14162 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SCARF1Q14162 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SCARF1Q14162 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SCARF1Q14162 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
SCARF1Q14162 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SCARF1Q14162 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCARF1Q14162 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCARF1Q14162 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCARF1Q14162 RNU6-274P-201ENST00000459566 107 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SCARF1Q14162 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SCARF1Q14162 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SCARF1Q14162 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCARF1Q14162 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCARF1Q14162 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCARF1Q14162 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCARF1Q14162 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCARF1Q14162 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SCARF1Q14162 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SCARF1Q14162 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
SCARF1Q14162 RNU6-752P-201ENST00000516376 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SCARF1Q14162 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SCARF1Q14162 MIR514B-201ENST00000516774 80 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SCARF1Q14162 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SCARF1Q14162 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SCARF1Q14162 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
SCARF1Q14162 RNU6-1079P-201ENST00000362861 110 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SCARF1Q14162 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SCARF1Q14162 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
SCARF1Q14162 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARF1Q14162 AL357793.1-201ENST00000448412 401 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARF1Q14162 RNU6-287P-201ENST00000516230 98 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARF1Q14162 RNU1-40P-201ENST00000516816 164 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARF1Q14162 RNU1-97P-201ENST00000516872 164 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARF1Q14162 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARF1Q14162 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARF1Q14162 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARF1Q14162 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARF1Q14162 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
SCARF1Q14162 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SCARF1Q14162 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCARF1Q14162 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCARF1Q14162 AL691482.2-201ENST00000457453 84 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCARF1Q14162 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCARF1Q14162 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCARF1Q14162 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCARF1Q14162 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SCARF1Q14162 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.24□□□□□ -2.05
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