Protein–RNA interactions for Protein: Q13671

RIN1, Ras and Rab interactor 1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIN1Q13671 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RIN1Q13671 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RIN1Q13671 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RIN1Q13671 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RIN1Q13671 MIR548BB-201ENST00000626714 66 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RIN1Q13671 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 Y_RNA.219-201ENST00000364232 113 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 Y_RNA.611-201ENST00000410682 108 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 RNU7-171P-201ENST00000459581 62 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 AC006160.2-201ENST00000637708 154 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 Y_RNA.426-201ENST00000384068 113 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 MIR519C-201ENST00000385053 87 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.24□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 SNORD78.1-201ENST00000390866 65 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.24□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 AC067940.1-201ENST00000458411 300 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 MIR3202-2-201ENST00000635980 79 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 RNU6-787P-201ENST00000384032 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 RNU6-1275P-201ENST00000391087 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RIN1Q13671 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.21□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 RNU6-228P-201ENST00000362700 106 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 RNU6-1124P-201ENST00000384169 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 MIR4666B-201ENST00000578142 81 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 AL157834.3-201ENST00000615543 103 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 Y_RNA.607-201ENST00000410597 98 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 RNU6-65P-201ENST00000516332 98 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 MIR19B1-201ENST00000384829 87 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 Y_RNA.685-201ENST00000516532 108 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.19□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 SNORD115-37-201ENST00000363768 82 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
RIN1Q13671 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC1.18□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.6 ms