Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 SNORD114-13-201ENST00000364377 74 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
ATRQ13535 MIR451A-201ENST00000385059 72 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
ATRQ13535 CYP3A54P-201ENST00000566950 75 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.64
ATRQ13535 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
ATRQ13535 RNU6-495P-201ENST00000362995 107 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
ATRQ13535 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
ATRQ13535 Y_RNA.509-201ENST00000384506 99 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
ATRQ13535 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
ATRQ13535 ST7-OT3_1.1-201ENST00000619607 74 ntBASIC-1.47□□□□□ -2.65
ATRQ13535 SNORD81.1-201ENST00000363064 77 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ATRQ13535 RNU6-990P-201ENST00000364385 104 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ATRQ13535 RNU6-458P-201ENST00000384179 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ATRQ13535 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ATRQ13535 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC-1.48□□□□□ -2.65
ATRQ13535 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ATRQ13535 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ATRQ13535 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ATRQ13535 U6.58-201ENST00000613107 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ATRQ13535 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ATRQ13535 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ATRQ13535 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ATRQ13535 RNU6-696P-201ENST00000390834 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ATRQ13535 RNU6-648P-201ENST00000410190 107 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ATRQ13535 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ATRQ13535 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ATRQ13535 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ATRQ13535 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC-1.48□□□□□ -2.65
ATRQ13535 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ATRQ13535 RNU6-935P-201ENST00000410371 100 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ATRQ13535 MTND2P39-201ENST00000457230 764 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ATRQ13535 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ATRQ13535 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ATRQ13535 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ATRQ13535 Y_RNA.618-201ENST00000410949 107 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ATRQ13535 Y_RNA.647-201ENST00000459194 112 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ATRQ13535 Y_RNA.640-201ENST00000459296 112 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ATRQ13535 MIR548AG1-201ENST00000579932 66 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ATRQ13535 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ATRQ13535 Y_RNA.803-201ENST00000614432 112 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ATRQ13535 Y_RNA.815-201ENST00000616655 112 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ATRQ13535 Y_RNA.795-201ENST00000619475 112 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ATRQ13535 Y_RNA.827-201ENST00000638104 112 ntBASIC-1.49□□□□□ -2.65
ATRQ13535 RNU6ATAC29P-201ENST00000408088 125 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ATRQ13535 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ATRQ13535 RNY1P6-201ENST00000384193 109 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ATRQ13535 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ATRQ13535 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ATRQ13535 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ATRQ13535 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ATRQ13535 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ATRQ13535 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ATRQ13535 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC-1.5□□□□□ -2.65
ATRQ13535 RNU6-500P-201ENST00000362349 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
ATRQ13535 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
ATRQ13535 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
ATRQ13535 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
ATRQ13535 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
ATRQ13535 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
ATRQ13535 MIR379-201ENST00000362218 67 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
ATRQ13535 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
ATRQ13535 RNU6-1044P-201ENST00000384755 107 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
ATRQ13535 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
ATRQ13535 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
ATRQ13535 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC-1.51□□□□□ -2.65
ATRQ13535 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
ATRQ13535 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
ATRQ13535 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
ATRQ13535 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
ATRQ13535 SNORA33.1-201ENST00000364957 130 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
ATRQ13535 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
ATRQ13535 MIR520D-201ENST00000385002 87 ntBASIC-1.52□□□□□ -2.65
ATRQ13535 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
ATRQ13535 Y_RNA.266-201ENST00000364678 96 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
ATRQ13535 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
ATRQ13535 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
ATRQ13535 Y_RNA.301-201ENST00000364990 103 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
ATRQ13535 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
ATRQ13535 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC-1.53□□□□□ -2.65
ATRQ13535 AL844175.1-201ENST00000455153 323 ntTSL 5 BASIC-1.53□□□□□ -2.65
ATRQ13535 RNU2-35P-201ENST00000516446 142 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
ATRQ13535 RNU6-971P-201ENST00000516920 106 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
ATRQ13535 MTND3P12-201ENST00000559068 328 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
ATRQ13535 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.65
ATRQ13535 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.66
ATRQ13535 Y_RNA.633-201ENST00000459107 95 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.66
ATRQ13535 MTND2P31-201ENST00000512602 616 ntBASIC-1.53□□□□□ -2.66
ATRQ13535 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
ATRQ13535 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
ATRQ13535 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
ATRQ13535 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
ATRQ13535 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
ATRQ13535 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
ATRQ13535 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC-1.54□□□□□ -2.66
ATRQ13535 U6.96-201ENST00000636425 70 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
ATRQ13535 SNORD113-3-201ENST00000364830 72 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
ATRQ13535 RNU6-132P-201ENST00000383863 107 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
ATRQ13535 RNY4P13-201ENST00000384284 96 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
ATRQ13535 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
ATRQ13535 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC-1.54□□□□□ -2.66
ATRQ13535 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC-1.54□□□□□ -2.66
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