Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 RNU6-934P-201ENST00000365154 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 RNU6-1051P-201ENST00000365471 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 AC074348.1-201ENST00000426503 132 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 RNU6-687P-201ENST00000516443 89 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 TRDV1-202ENST00000621643 102 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
FOXE3Q13461 Y_RNA.12-201ENST00000362393 112 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 RNU6-807P-201ENST00000516805 107 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 RNU6-303P-201ENST00000517091 106 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 MIR4696-201ENST00000581431 70 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 MIR1297-201ENST00000637311 77 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 RNU6-590P-201ENST00000365039 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 RNU6-237P-201ENST00000515985 71 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 YWHAEP2-201ENST00000580066 112 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 YWHAEP3-201ENST00000582767 121 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 U6.100-201ENST00000636230 99 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 RNU6-664P-201ENST00000362381 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 Y_RNA.207-201ENST00000364142 106 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 TRAJ42-201ENST00000390495 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.38□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 RNU6-539P-201ENST00000516665 103 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.37□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 RNU5F-1-201ENST00000362507 117 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 RNU6-330P-201ENST00000363015 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.37□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 MIR4771-1-201ENST00000582617 74 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 SNORD101-201ENST00000384027 73 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 5S_rRNA.2-201ENST00000391293 112 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 RNU6-634P-201ENST00000459134 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 RNU6-871P-201ENST00000516122 100 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.35□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 MIR599-201ENST00000385069 95 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 RNU6-587P-201ENST00000391282 106 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 RNU6-1052P-201ENST00000411398 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 RNU6-719P-201ENST00000516671 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 DLEU2_3.1-201ENST00000620005 73 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.34□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 RNA5SP432-201ENST00000362480 116 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
FOXE3Q13461 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 RNU6-340P-201ENST00000364005 107 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
FOXE3Q13461 SNORA8.1-201ENST00000384250 140 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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