| PTK7 | Q13308 | RNU7-40P-201 | ENST00000516397 | 64 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR4676-201 | ENST00000583078 | 72 nt | BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| PTK7 | Q13308 | KIAA1107-201 | ENST00000370378 | 4622 nt | TSL 5 BASIC | 1.89 | □□□□□ -2.11 | | |
| PTK7 | Q13308 | SNORD115-27-201 | ENST00000364430 | 82 nt | BASIC | 1.88 | □□□□□ -2.11 | | |
| PTK7 | Q13308 | Y_RNA.536-201 | ENST00000384621 | 113 nt | BASIC | 1.88 | □□□□□ -2.11 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR938-201 | ENST00000401216 | 83 nt | BASIC | 1.88 | □□□□□ -2.11 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC015818.7-201 | ENST00000428754 | 109 nt | BASIC | 1.88 | □□□□□ -2.11 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC087499.7-201 | ENST00000441958 | 109 nt | BASIC | 1.88 | □□□□□ -2.11 | | |
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| PTK7 | Q13308 | AL359821.1-201 | ENST00000605519 | 182 nt | BASIC | 1.88 | □□□□□ -2.11 | | |
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| PTK7 | Q13308 | SYT14-201 | ENST00000367015 | 5094 nt | APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC | 1.87 | □□□□□ -2.11 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR1-1-201 | ENST00000362147 | 71 nt | BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
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| PTK7 | Q13308 | SKIL-204 | ENST00000458537 | 7182 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.86 | □□□□□ -2.11 | | |
| PTK7 | Q13308 | KIAA1551-201 | ENST00000312561 | 6230 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.85 | □□□□□ -2.11 | | |
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| PTK7 | Q13308 | RNU7-95P-201 | ENST00000459222 | 64 nt | BASIC | 1.84 | □□□□□ -2.11 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU7-106P-201 | ENST00000459514 | 67 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| PTK7 | Q13308 | TRMT112P2-201 | ENST00000512910 | 132 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC093729.1-201 | ENST00000513074 | 128 nt | BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| PTK7 | Q13308 | HIF1A-204 | ENST00000539097 | 3956 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| PTK7 | Q13308 | ZGRF1-203 | ENST00000445203 | 6529 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 1.83 | □□□□□ -2.12 | | |
| PTK7 | Q13308 | OMD-201 | ENST00000375550 | 2449 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU4-32P-201 | ENST00000363404 | 141 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR519A1-201 | ENST00000385257 | 85 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU1-119P-201 | ENST00000391122 | 165 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| PTK7 | Q13308 | snoU13.11-201 | ENST00000459219 | 104 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC078980.1-201 | ENST00000485384 | 262 nt | TSL 2 BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| PTK7 | Q13308 | TRAJ51-201 | ENST00000504127 | 63 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC140658.3-201 | ENST00000567603 | 271 nt | BASIC | 1.82 | □□□□□ -2.12 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-1229P-201 | ENST00000364295 | 107 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| PTK7 | Q13308 | SNORD48-201 | ENST00000364953 | 64 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| PTK7 | Q13308 | SNORA25-201 | ENST00000384384 | 134 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| PTK7 | Q13308 | TRAJ61-201 | ENST00000390479 | 60 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR1287-201 | ENST00000408492 | 90 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC092628.1-201 | ENST00000436250 | 252 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU7-85P-201 | ENST00000458851 | 63 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| PTK7 | Q13308 | Y_RNA.809-201 | ENST00000516058 | 95 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC138907.6-201 | ENST00000568401 | 126 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC138869.1-201 | ENST00000568623 | 124 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| PTK7 | Q13308 | SNORD53B-201 | ENST00000577887 | 78 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR4804-201 | ENST00000581683 | 73 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL645939.4-201 | ENST00000604495 | 135 nt | BASIC | 1.81 | □□□□□ -2.12 | | |
| PTK7 | Q13308 | MBNL3-212 | ENST00000538204 | 11294 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.8 | □□□□□ -2.12 | | |
| PTK7 | Q13308 | JMJD1C-212 | ENST00000639129 | 7901 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 1.8 | □□□□□ -2.12 | | |
| PTK7 | Q13308 | Y_RNA.283-201 | ENST00000364798 | 112 nt | BASIC | 1.8 | □□□□□ -2.12 | | |
| PTK7 | Q13308 | ZNF468-202 | ENST00000396409 | 384 nt | TSL 5 BASIC | 1.8 | □□□□□ -2.12 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR889-201 | ENST00000401280 | 79 nt | BASIC | 1.8 | □□□□□ -2.12 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU7-102P-201 | ENST00000458948 | 62 nt | BASIC | 1.8 | □□□□□ -2.12 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-535P-201 | ENST00000384722 | 107 nt | BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU7-195P-201 | ENST00000458793 | 62 nt | BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-448P-201 | ENST00000517052 | 107 nt | BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
| PTK7 | Q13308 | VPS35-212 | ENST00000640313 | 141 nt | TSL 5 BASIC | 1.79 | □□□□□ -2.12 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-1260P-201 | ENST00000362944 | 107 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC002429.1-201 | ENST00000437672 | 148 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC097635.1-201 | ENST00000450678 | 155 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC032019.2-201 | ENST00000584916 | 403 nt | TSL 5 BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| PTK7 | Q13308 | AC145423.2-201 | ENST00000610631 | 239 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| PTK7 | Q13308 | AL136317.1-201 | ENST00000612653 | 226 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR8070-201 | ENST00000616510 | 88 nt | BASIC | 1.78 | □□□□□ -2.12 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-315P-201 | ENST00000362666 | 107 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU1-42P-201 | ENST00000364033 | 160 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-811P-201 | ENST00000384069 | 107 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR520F-201 | ENST00000384824 | 87 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| PTK7 | Q13308 | TRAJ3-201 | ENST00000390534 | 62 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR548U-201 | ENST00000390728 | 81 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-788P-201 | ENST00000390967 | 104 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR1827-201 | ENST00000408549 | 66 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU7-56P-201 | ENST00000458744 | 62 nt | BASIC | 1.77 | □□□□□ -2.13 | | |
| PTK7 | Q13308 | ANGPTL3-201 | ENST00000371129 | 2805 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-997P-201 | ENST00000384725 | 107 nt | BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| PTK7 | Q13308 | CCDC68-202 | ENST00000432185 | 4014 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.76 | □□□□□ -2.13 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNA5SP327-201 | ENST00000362494 | 101 nt | BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU6-369P-201 | ENST00000362515 | 102 nt | BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| PTK7 | Q13308 | Y_RNA.508-201 | ENST00000384502 | 114 nt | BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| PTK7 | Q13308 | RNU4ATAC9P-201 | ENST00000517146 | 126 nt | BASIC | 1.75 | □□□□□ -2.13 | | |
| PTK7 | Q13308 | Y_RNA.565-201 | ENST00000384719 | 101 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| PTK7 | Q13308 | MIR517C-201 | ENST00000385103 | 95 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| PTK7 | Q13308 | SNORA67.6-201 | ENST00000391093 | 99 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |
| PTK7 | Q13308 | FABP5P4-201 | ENST00000437203 | 171 nt | BASIC | 1.74 | □□□□□ -2.13 | | |