Protein–RNA interactions for Protein: Q13308

PTK7, Inactive tyrosine-protein kinase 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK7Q13308 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTK7Q13308 MIR4676-201ENST00000583078 72 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
PTK7Q13308 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
PTK7Q13308 SNORD115-27-201ENST00000364430 82 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTK7Q13308 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTK7Q13308 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTK7Q13308 AC015818.7-201ENST00000428754 109 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTK7Q13308 AC087499.7-201ENST00000441958 109 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTK7Q13308 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTK7Q13308 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTK7Q13308 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
PTK7Q13308 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTK7Q13308 SNORD36A-201ENST00000362874 73 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTK7Q13308 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTK7Q13308 AC073261.1-201ENST00000429409 121 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTK7Q13308 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTK7Q13308 AC139453.2-201ENST00000487255 133 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTK7Q13308 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
PTK7Q13308 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.87□□□□□ -2.11
PTK7Q13308 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTK7Q13308 MIR100-201ENST00000385259 80 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTK7Q13308 RNU6-466P-201ENST00000391224 103 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTK7Q13308 MIR1236-201ENST00000408340 102 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTK7Q13308 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTK7Q13308 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTK7Q13308 MIR4712-201ENST00000583750 82 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTK7Q13308 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
PTK7Q13308 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTK7Q13308 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
PTK7Q13308 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTK7Q13308 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTK7Q13308 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTK7Q13308 RPS27-201ENST00000368567 350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTK7Q13308 RNU6-524P-201ENST00000384270 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTK7Q13308 MIR4536-1-201ENST00000583537 88 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTK7Q13308 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTK7Q13308 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTK7Q13308 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTK7Q13308 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTK7Q13308 AC093729.1-201ENST00000513074 128 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTK7Q13308 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTK7Q13308 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTK7Q13308 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTK7Q13308 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTK7Q13308 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTK7Q13308 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTK7Q13308 snoU13.11-201ENST00000459219 104 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTK7Q13308 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PTK7Q13308 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTK7Q13308 AC140658.3-201ENST00000567603 271 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTK7Q13308 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTK7Q13308 SNORD48-201ENST00000364953 64 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTK7Q13308 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTK7Q13308 TRAJ61-201ENST00000390479 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PTK7Q13308 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTK7Q13308 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTK7Q13308 RNU7-85P-201ENST00000458851 63 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTK7Q13308 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTK7Q13308 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTK7Q13308 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTK7Q13308 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTK7Q13308 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTK7Q13308 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PTK7Q13308 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTK7Q13308 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTK7Q13308 Y_RNA.283-201ENST00000364798 112 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTK7Q13308 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PTK7Q13308 MIR889-201ENST00000401280 79 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTK7Q13308 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PTK7Q13308 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTK7Q13308 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTK7Q13308 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PTK7Q13308 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PTK7Q13308 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTK7Q13308 AC002429.1-201ENST00000437672 148 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTK7Q13308 AC097635.1-201ENST00000450678 155 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTK7Q13308 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PTK7Q13308 AC145423.2-201ENST00000610631 239 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTK7Q13308 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTK7Q13308 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PTK7Q13308 RNU6-315P-201ENST00000362666 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTK7Q13308 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTK7Q13308 RNU6-811P-201ENST00000384069 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTK7Q13308 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTK7Q13308 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PTK7Q13308 MIR548U-201ENST00000390728 81 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTK7Q13308 RNU6-788P-201ENST00000390967 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTK7Q13308 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTK7Q13308 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PTK7Q13308 ANGPTL3-201ENST00000371129 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTK7Q13308 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PTK7Q13308 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.76□□□□□ -2.13
PTK7Q13308 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTK7Q13308 RNU6-369P-201ENST00000362515 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTK7Q13308 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTK7Q13308 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PTK7Q13308 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTK7Q13308 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTK7Q13308 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PTK7Q13308 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms