Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.69□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 RNU6-429P-201ENST00000384582 108 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 MIR330-201ENST00000362196 94 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 Y_RNA.35-201ENST00000362601 101 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 Y_RNA.309-201ENST00000365046 111 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 Y_RNA.360-201ENST00000365512 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 RNU6-476P-201ENST00000384726 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 MIR1912-201ENST00000410389 80 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 AL162399.1-201ENST00000426090 130 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 RNU6-469P-201ENST00000516253 101 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 SNORA31.14-201ENST00000516728 116 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 RNA5SP395-201ENST00000516567 118 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 MIR6129-201ENST00000616087 109 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
CHAF1AQ13111 RNU6-1144P-201ENST00000384247 104 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 AC079760.1-201ENST00000456952 202 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 AC068339.1-201ENST00000526965 141 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 U2.22-201ENST00000636441 106 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.65□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 RNU6-1313P-201ENST00000362622 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 RNA5SP245-201ENST00000364239 121 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC0.64□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 Y_RNA.49-201ENST00000362714 112 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 Y_RNA.56-201ENST00000362798 112 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 U8.6-201ENST00000364939 135 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 LMBR1-222ENST00000638959 93 ntTSL 5 BASIC0.63□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.62□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 Y_RNA.247-201ENST00000364500 92 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 RNU6-1201P-201ENST00000384227 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 MIR635-201ENST00000384830 98 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 MIR5009-201ENST00000578736 100 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 MIR577-201ENST00000385196 96 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 AL442128.1-201ENST00000615151 90 ntBASIC0.6□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 RNU6-1107P-201ENST00000364817 104 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 HAR1A.1-201ENST00000459583 118 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 MIR4694-201ENST00000578534 80 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.59□□□□□ -2.31
CHAF1AQ13111 RNU6-170P-201ENST00000362832 104 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHAF1AQ13111 SNORD18A-201ENST00000363753 72 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHAF1AQ13111 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHAF1AQ13111 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHAF1AQ13111 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHAF1AQ13111 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHAF1AQ13111 RNA5SP94-201ENST00000516917 108 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHAF1AQ13111 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHAF1AQ13111 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHAF1AQ13111 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHAF1AQ13111 NEAT1_2.1-201ENST00000620525 105 ntBASIC0.58□□□□□ -2.32
CHAF1AQ13111 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHAF1AQ13111 RNU6-832P-201ENST00000363319 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHAF1AQ13111 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHAF1AQ13111 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHAF1AQ13111 MIR548AI-201ENST00000579940 88 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CHAF1AQ13111 RNY3P2-201ENST00000362918 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CHAF1AQ13111 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
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