Protein–RNA interactions for Protein: Q12948

FOXC1, Forkhead box protein C1, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXC1Q12948 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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FOXC1Q12948 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXC1Q12948 MIR6509-201ENST00000614603 85 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
FOXC1Q12948 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXC1Q12948 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXC1Q12948 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXC1Q12948 RNU6ATAC6P-201ENST00000408132 126 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXC1Q12948 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXC1Q12948 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
FOXC1Q12948 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC2.35□□□□□ -2.03
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FOXC1Q12948 OXR1-209ENST00000517566 4501 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXC1Q12948 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXC1Q12948 MIR125B2-201ENST00000385128 89 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXC1Q12948 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXC1Q12948 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXC1Q12948 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
FOXC1Q12948 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXC1Q12948 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXC1Q12948 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXC1Q12948 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXC1Q12948 MIR548AG2-201ENST00000581228 64 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXC1Q12948 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXC1Q12948 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
FOXC1Q12948 RNA5SP215-201ENST00000363440 122 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXC1Q12948 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
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FOXC1Q12948 MIR3657-201ENST00000584818 117 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXC1Q12948 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.32□□□□□ -2.04
FOXC1Q12948 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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FOXC1Q12948 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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FOXC1Q12948 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.28□□□□□ -2.04
FOXC1Q12948 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
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FOXC1Q12948 MIR489-201ENST00000384923 84 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXC1Q12948 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
FOXC1Q12948 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
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FOXC1Q12948 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
FOXC1Q12948 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
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FOXC1Q12948 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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FOXC1Q12948 MIR4771-2-201ENST00000577758 74 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
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FOXC1Q12948 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.23□□□□□ -2.05
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FOXC1Q12948 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXC1Q12948 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXC1Q12948 MIR6739-201ENST00000622461 75 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXC1Q12948 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXC1Q12948 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXC1Q12948 SACS-201ENST00000382292 15324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
FOXC1Q12948 SNORA2.1-201ENST00000363089 137 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXC1Q12948 RNA5SP456-201ENST00000364002 114 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXC1Q12948 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXC1Q12948 AC108667.1-201ENST00000428618 249 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
FOXC1Q12948 SNORD42B-201ENST00000458893 67 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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