Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

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Length 222 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HOXC5Q00444 AC097510.1-201ENST00000510945 133 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HOXC5Q00444 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HOXC5Q00444 RNU6-881P-201ENST00000516813 102 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HOXC5Q00444 SNORA40.17-201ENST00000517256 115 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HOXC5Q00444 MIR4802-201ENST00000581881 80 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HOXC5Q00444 Y_RNA.773-201ENST00000607168 90 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HOXC5Q00444 MIR548O2-201ENST00000616090 70 ntBASIC-0.7□□□□□ -2.52
HOXC5Q00444 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HOXC5Q00444 SNORD115-19-201ENST00000363098 82 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HOXC5Q00444 SNORD115-18-201ENST00000363293 82 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HOXC5Q00444 RNU6-957P-201ENST00000363652 99 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HOXC5Q00444 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HOXC5Q00444 RNU4-36P-201ENST00000364294 144 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HOXC5Q00444 SNORD115-17-201ENST00000364612 82 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HOXC5Q00444 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HOXC5Q00444 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HOXC5Q00444 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HOXC5Q00444 MIR582-201ENST00000365731 98 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HOXC5Q00444 Y_RNA.437-201ENST00000384113 113 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HOXC5Q00444 MIR7-2-201ENST00000384970 110 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HOXC5Q00444 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HOXC5Q00444 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HOXC5Q00444 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HOXC5Q00444 MTATP6P21-201ENST00000440681 189 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HOXC5Q00444 SNORA13-201ENST00000458790 133 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HOXC5Q00444 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HOXC5Q00444 SCARNA17.3-201ENST00000516381 125 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HOXC5Q00444 AC108081.1-201ENST00000604358 221 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HOXC5Q00444 AL160413.1-201ENST00000622780 310 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HOXC5Q00444 AC134503.1-201ENST00000633048 54 ntBASIC-0.71□□□□□ -2.52
HOXC5Q00444 RNU6-973P-201ENST00000364690 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HOXC5Q00444 Y_RNA.352-201ENST00000365439 102 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HOXC5Q00444 MT-TI-201ENST00000387365 69 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HOXC5Q00444 RNU6-243P-201ENST00000391140 107 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HOXC5Q00444 MIR548E-201ENST00000408287 88 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HOXC5Q00444 RNU6-1006P-201ENST00000516998 103 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HOXC5Q00444 MIR5704-201ENST00000584029 77 ntBASIC-0.72□□□□□ -2.52
HOXC5Q00444 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HOXC5Q00444 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HOXC5Q00444 RNU6-235P-201ENST00000362644 107 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HOXC5Q00444 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HOXC5Q00444 Y_RNA.239-201ENST00000364444 113 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HOXC5Q00444 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HOXC5Q00444 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
HOXC5Q00444 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-0.73□□□□□ -2.53
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HOXC5Q00444 Y_RNA.78-201ENST00000362970 110 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
HOXC5Q00444 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
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HOXC5Q00444 MIR3179-3-201ENST00000579566 84 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
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HOXC5Q00444 MIR3179-4-201ENST00000617599 84 ntBASIC-0.74□□□□□ -2.53
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HOXC5Q00444 MIR196A1-201ENST00000388006 70 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
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HOXC5Q00444 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HOXC5Q00444 AL353813.1-201ENST00000440700 253 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HOXC5Q00444 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HOXC5Q00444 RNU7-6P-201ENST00000516845 62 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HOXC5Q00444 RNU6-762P-201ENST00000517107 102 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HOXC5Q00444 RNU4ATAC9P-201ENST00000517146 126 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HOXC5Q00444 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
HOXC5Q00444 Y_RNA.189-201ENST00000363959 112 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HOXC5Q00444 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HOXC5Q00444 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HOXC5Q00444 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HOXC5Q00444 MT-TQ-201ENST00000387372 72 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
HOXC5Q00444 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
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