Protein–RNA interactions for Protein: P35247

SFTPD, Pulmonary surfactant-associated protein D, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPDP35247 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SFTPDP35247 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SFTPDP35247 SNORD63B-201ENST00000411005 70 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SFTPDP35247 RNU7-195P-201ENST00000458793 62 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SFTPDP35247 RNU6-848P-201ENST00000515948 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SFTPDP35247 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SFTPDP35247 RNU6-617P-201ENST00000516147 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SFTPDP35247 RNU6-473P-201ENST00000516164 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SFTPDP35247 RNU6-1049P-201ENST00000516414 107 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SFTPDP35247 AC067863.3-201ENST00000624172 122 ntBASIC0.1□□□□□ -2.39
SFTPDP35247 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.09□□□□□ -2.39
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SFTPDP35247 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
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SFTPDP35247 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SFTPDP35247 MIR519A1-201ENST00000385257 85 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
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SFTPDP35247 SNORD41.1-201ENST00000391000 69 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
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SFTPDP35247 RNU7-106P-201ENST00000459514 67 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
SFTPDP35247 RNU7-129P-201ENST00000516128 62 ntBASIC0.09□□□□□ -2.4
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SFTPDP35247 RNA5SP214-201ENST00000363378 118 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SFTPDP35247 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SFTPDP35247 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SFTPDP35247 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SFTPDP35247 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
SFTPDP35247 RPL39P34-201ENST00000477141 156 ntBASIC0.08□□□□□ -2.4
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SFTPDP35247 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SFTPDP35247 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SFTPDP35247 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC0.07□□□□□ -2.4
SFTPDP35247 SNORD114-9-201ENST00000364370 72 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
SFTPDP35247 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC0.06□□□□□ -2.4
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SFTPDP35247 SNORD58C-201ENST00000365223 64 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
SFTPDP35247 Y_RNA.344-201ENST00000365381 112 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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SFTPDP35247 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
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SFTPDP35247 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
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SFTPDP35247 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SFTPDP35247 NFIA-AS1-206ENST00000630199 220 ntTSL 5 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
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SFTPDP35247 RNU6-409P-201ENST00000384114 104 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SFTPDP35247 MIR593-201ENST00000384856 100 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SFTPDP35247 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SFTPDP35247 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SFTPDP35247 RNU6-1211P-201ENST00000459179 105 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
SFTPDP35247 RNU6-1018P-201ENST00000516577 106 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
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