Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 Y_RNA.467-201ENST00000384297 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CTIFO43310 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CTIFO43310 AC004941.2-201ENST00000427009 228 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CTIFO43310 MTATP8P2-201ENST00000435212 202 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CTIFO43310 RNU6-977P-201ENST00000516411 103 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
CTIFO43310 Y_RNA.93-201ENST00000363066 109 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CTIFO43310 RNU6-644P-201ENST00000391155 98 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CTIFO43310 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CTIFO43310 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CTIFO43310 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CTIFO43310 SNORA40.13-201ENST00000516379 120 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CTIFO43310 RNU6-158P-201ENST00000517104 100 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CTIFO43310 MIR4661-201ENST00000582720 75 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CTIFO43310 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CTIFO43310 ST7-AS2_1.1-201ENST00000622900 72 ntBASIC1□□□□□ -2.25
CTIFO43310 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CTIFO43310 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CTIFO43310 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CTIFO43310 RNA5SP255-201ENST00000516370 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CTIFO43310 RNU7-156P-201ENST00000517214 74 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CTIFO43310 MTND5P40-201ENST00000559945 246 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CTIFO43310 MIR4804-201ENST00000581683 73 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CTIFO43310 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CTIFO43310 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
CTIFO43310 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CTIFO43310 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CTIFO43310 MIR488-201ENST00000365739 83 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CTIFO43310 MIR193B-201ENST00000384907 83 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CTIFO43310 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CTIFO43310 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
CTIFO43310 RNU7-61P-201ENST00000515897 61 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CTIFO43310 RNA5SP436-201ENST00000516020 115 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CTIFO43310 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CTIFO43310 SNORD92-201ENST00000585078 85 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CTIFO43310 AC013244.2-201ENST00000603396 103 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CTIFO43310 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CTIFO43310 RNU6-86P-201ENST00000606534 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
CTIFO43310 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
CTIFO43310 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.98□□□□□ -2.25
CTIFO43310 FAM135A-203ENST00000370479 5930 ntTSL 1 (best) BASIC0.97□□□□□ -2.25
CTIFO43310 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CTIFO43310 MIR520F-201ENST00000384824 87 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CTIFO43310 MIR146A-201ENST00000385201 99 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CTIFO43310 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CTIFO43310 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.97□□□□□ -2.25
CTIFO43310 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC0.97□□□□□ -2.25
CTIFO43310 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CTIFO43310 Y_RNA.342-201ENST00000365352 113 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CTIFO43310 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CTIFO43310 RNU7-56P-201ENST00000458744 62 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CTIFO43310 RNU6-850P-201ENST00000516934 103 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CTIFO43310 RNA5SP170-201ENST00000517150 101 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CTIFO43310 MIR1273G-201ENST00000577677 100 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CTIFO43310 MIR4439-201ENST00000583746 80 ntBASIC0.96□□□□□ -2.26
CTIFO43310 RNA5SP457-201ENST00000363657 124 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CTIFO43310 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CTIFO43310 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CTIFO43310 RNY4P30-201ENST00000410216 95 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CTIFO43310 RNU6-162P-201ENST00000516228 103 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CTIFO43310 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CTIFO43310 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.95□□□□□ -2.26
CTIFO43310 Y_RNA.290-201ENST00000364879 114 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CTIFO43310 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CTIFO43310 Y_RNA.433-201ENST00000384089 102 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CTIFO43310 RNU6-571P-201ENST00000384128 107 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CTIFO43310 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CTIFO43310 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CTIFO43310 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CTIFO43310 RNU6-1194P-201ENST00000516208 104 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CTIFO43310 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CTIFO43310 Y_RNA.694-201ENST00000516677 117 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CTIFO43310 AC103810.7-201ENST00000607821 91 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CTIFO43310 U7.3-201ENST00000616123 62 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CTIFO43310 MALAT1.1-201ENST00000618249 95 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CTIFO43310 MIR2052-201ENST00000636055 55 ntBASIC0.94□□□□□ -2.26
CTIFO43310 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.94□□□□□ -2.26
CTIFO43310 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CTIFO43310 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CTIFO43310 RNY1P7-201ENST00000384743 110 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CTIFO43310 RNU6ATAC31P-201ENST00000408513 126 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CTIFO43310 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC0.93□□□□□ -2.26
CTIFO43310 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CTIFO43310 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CTIFO43310 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CTIFO43310 ST7-OT3_3.1-201ENST00000611709 115 ntBASIC0.93□□□□□ -2.26
CTIFO43310 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.92□□□□□ -2.26
CTIFO43310 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CTIFO43310 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CTIFO43310 MIR520H-201ENST00000385126 88 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CTIFO43310 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CTIFO43310 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CTIFO43310 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC0.92□□□□□ -2.26
CTIFO43310 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.91□□□□□ -2.26
CTIFO43310 Y_RNA.115-201ENST00000363272 98 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CTIFO43310 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CTIFO43310 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CTIFO43310 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CTIFO43310 TRAJ51-201ENST00000504127 63 ntBASIC0.91□□□□□ -2.26
CTIFO43310 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
CTIFO43310 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC0.9□□□□□ -2.27
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