Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Z69908.1-201ENST00000622603 247 ntBASIC-2.35□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNY4P27-201ENST00000363341 96 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-561P-201ENST00000516222 102 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.693-201ENST00000516641 110 ntBASIC-2.36□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.284-201ENST00000364806 102 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-695P-201ENST00000391157 104 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-88P-201ENST00000458752 63 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC-2.37□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA15B-2-201ENST00000384058 135 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA15B-1-201ENST00000384334 135 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-370P-201ENST00000411008 104 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01984-201ENST00000583863 301 ntTSL 3 BASIC-2.38□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP000720.1-201ENST00000625091 483 ntBASIC-2.38□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA79-201ENST00000408376 140 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-240P-201ENST00000516098 97 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-154P-201ENST00000516194 62 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1281P-201ENST00000516223 105 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1234P-201ENST00000516877 103 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 U7.5-201ENST00000517224 61 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC-2.39□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC-2.39□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Z83846.1-201ENST00000446798 265 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-75P-201ENST00000515944 104 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-521P-201ENST00000516663 105 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNRD1-AS1_1.6-201ENST00000610339 68 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC-2.4□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CR2-207ENST00000640301 151 ntTSL 1 (best) BASIC-2.4□□□□□ -2.79
TRBV7-4A0A0J9YYF1 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-880P-201ENST00000384526 107 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR519A2-201ENST00000384990 87 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IL6ST-207ENST00000396816 168 ntTSL 1 (best) BASIC-2.41□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC-2.41□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 snoU13.17-201ENST00000458802 104 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP147-201ENST00000516493 109 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC-2.41□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.10-201ENST00000362371 110 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.491-201ENST00000384417 107 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-24P-201ENST00000458867 62 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC-2.42□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIRLET7F1-201ENST00000362202 87 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-841P-201ENST00000383872 107 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR3140-201ENST00000583685 90 ntBASIC-2.43□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.569-201ENST00000384749 103 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRAJ48-201ENST00000390489 63 ntAPPRIS P1 BASIC-2.44□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR548Q-201ENST00000408404 100 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC-2.44□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR548AM-201ENST00000584298 74 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC-2.44□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA63.2-201ENST00000362603 126 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.298-201ENST00000364960 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-260P-201ENST00000384092 107 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR3123-201ENST00000583417 75 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC-2.45□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-246P-201ENST00000384702 107 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1177P-201ENST00000391058 104 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-2.46□□□□□ -2.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 171.4 ms