Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 MIR548G-201ENST00000408442 89 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SEMA4CQ9C0C4 RN7SKP88-201ENST00000516847 250 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SEMA4CQ9C0C4 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SEMA4CQ9C0C4 MIR4500-201ENST00000579472 76 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SEMA4CQ9C0C4 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SEMA4CQ9C0C4 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SEMA4CQ9C0C4 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SEMA4CQ9C0C4 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SEMA4CQ9C0C4 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SEMA4CQ9C0C4 RNA5SP133-201ENST00000363368 119 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SEMA4CQ9C0C4 SNORD38.1-201ENST00000363863 68 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SEMA4CQ9C0C4 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SEMA4CQ9C0C4 Y_RNA.593-201ENST00000410292 98 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SEMA4CQ9C0C4 SNORD83.1-201ENST00000411362 77 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SEMA4CQ9C0C4 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SEMA4CQ9C0C4 Y_RNA.705-201ENST00000516862 110 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SEMA4CQ9C0C4 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SEMA4CQ9C0C4 AC023827.1-201ENST00000569247 97 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SEMA4CQ9C0C4 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
SEMA4CQ9C0C4 G3BP1-214ENST00000627077 114 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
SEMA4CQ9C0C4 Y_RNA.17-201ENST00000362433 111 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SEMA4CQ9C0C4 Y_RNA.73-201ENST00000362910 113 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-573P-201ENST00000383938 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SEMA4CQ9C0C4 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SEMA4CQ9C0C4 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SEMA4CQ9C0C4 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SEMA4CQ9C0C4 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SEMA4CQ9C0C4 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-887P-201ENST00000410660 100 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SEMA4CQ9C0C4 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SEMA4CQ9C0C4 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-267P-201ENST00000516714 103 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SEMA4CQ9C0C4 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-90P-201ENST00000606352 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SEMA4CQ9C0C4 AP001362.1-201ENST00000625165 124 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
SEMA4CQ9C0C4 IST1-227ENST00000626438 126 ntTSL 5 BASIC1.29□□□□□ -2.2
SEMA4CQ9C0C4 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
SEMA4CQ9C0C4 RNA5SP173-201ENST00000364857 136 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SEMA4CQ9C0C4 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SEMA4CQ9C0C4 SNORA72.6-201ENST00000384520 129 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-813P-201ENST00000384691 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-402P-201ENST00000410678 103 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SEMA4CQ9C0C4 AC096949.1-201ENST00000412047 152 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SEMA4CQ9C0C4 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
SEMA4CQ9C0C4 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.27□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 Y_RNA.119-201ENST00000363301 96 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 AC025521.1-201ENST00000621624 286 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-1244P-201ENST00000363614 108 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 RNY1P4-201ENST00000384595 115 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 TRAJ1-201ENST00000390536 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-613P-201ENST00000410412 108 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 COX7A2-206ENST00000472311 325 ntTSL 2 BASIC1.26□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-531P-201ENST00000516694 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 ZGRF1-202ENST00000309071 3347 ntTSL 1 (best) BASIC1.25□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 SNORD58A-201ENST00000383875 65 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-972P-201ENST00000391208 107 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 RNU6ATAC41P-201ENST00000408600 126 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 RN7SL793P-201ENST00000583259 296 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 RNY1P2-201ENST00000364820 117 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 MIR450A2-201ENST00000385022 100 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 Y_RNA.609-201ENST00000410669 89 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 snoMBII-202.2-201ENST00000517263 86 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 5S_rRNA.15-201ENST00000611169 127 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 Y_RNA.173-201ENST00000363776 113 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 RNY1P1-201ENST00000364372 112 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-497P-201ENST00000365316 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 SNORD38.2-201ENST00000384470 69 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 MIR1302-4-201ENST00000408701 150 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
SEMA4CQ9C0C4 AL513043.2-201ENST00000573941 143 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
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