Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ16

SPOCK3, Testican-3, humanhuman

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP299-201ENST00000391203 116 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 AC023934.1-201ENST00000574529 2389 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1260P-201ENST00000362944 107 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 SNORA25.16-201ENST00000516741 121 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 RNU4-58P-201ENST00000363192 141 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-35P-201ENST00000384530 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 UQCRHP3-201ENST00000451503 251 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.809-201ENST00000516058 95 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 SNORD60.1-201ENST00000362451 73 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 SNORA3.2-201ENST00000408221 125 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 RNU7-41P-201ENST00000515917 61 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-92P-201ENST00000605893 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 uc_338.10-201ENST00000621872 182 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.36□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 MIR4491-201ENST00000581087 68 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 AC073869.9-201ENST00000641610 120 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-980P-201ENST00000516925 103 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 MIR3198-2-201ENST00000577868 80 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SPOCK3Q9BQ16 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SPOCK3Q9BQ16 Y_RNA.588-201ENST00000391254 102 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SPOCK3Q9BQ16 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SPOCK3Q9BQ16 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
SPOCK3Q9BQ16 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SPOCK3Q9BQ16 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
SPOCK3Q9BQ16 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-645P-201ENST00000364649 106 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SPOCK3Q9BQ16 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SPOCK3Q9BQ16 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
SPOCK3Q9BQ16 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SPOCK3Q9BQ16 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC2.31□□□□□ -2.04
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-930P-201ENST00000390938 100 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SPOCK3Q9BQ16 RNU4-53P-201ENST00000410828 140 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SPOCK3Q9BQ16 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SPOCK3Q9BQ16 MIR548H5-201ENST00000580314 60 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
SPOCK3Q9BQ16 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
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SPOCK3Q9BQ16 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1039P-201ENST00000383931 107 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SPOCK3Q9BQ16 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SPOCK3Q9BQ16 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SPOCK3Q9BQ16 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SPOCK3Q9BQ16 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SPOCK3Q9BQ16 RNU7-10P-201ENST00000607194 63 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
SPOCK3Q9BQ16 MIR101-2-201ENST00000362195 79 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SPOCK3Q9BQ16 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SPOCK3Q9BQ16 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SPOCK3Q9BQ16 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SPOCK3Q9BQ16 U3.27-201ENST00000391237 200 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SPOCK3Q9BQ16 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SPOCK3Q9BQ16 MIR548F3-201ENST00000408509 87 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SPOCK3Q9BQ16 SNORD75.2-201ENST00000408784 58 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SPOCK3Q9BQ16 AC003982.1-202ENST00000469928 248 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SPOCK3Q9BQ16 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SPOCK3Q9BQ16 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
SPOCK3Q9BQ16 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
SPOCK3Q9BQ16 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SPOCK3Q9BQ16 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SPOCK3Q9BQ16 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
SPOCK3Q9BQ16 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.05
SPOCK3Q9BQ16 RNU6-520P-201ENST00000384717 104 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
SPOCK3Q9BQ16 MIR203A-201ENST00000384836 110 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
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