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Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4A7
SFXN4, Sideroflexin-4, human
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene
UniProt Accession
Transcript Symbol
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
p-Value
Fold Change
SFXN4
Q6P4A7
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167 nt
BASIC
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□□□□□ -2.67
SFXN4
Q6P4A7
SCARNA17.3-201
ENST00000516381
125 nt
BASIC
-1.61
□□□□□ -2.67
SFXN4
Q6P4A7
MIR6854-201
ENST00000614935
69 nt
BASIC
-1.61
□□□□□ -2.67
SFXN4
Q6P4A7
Y_RNA.35-201
ENST00000362601
101 nt
BASIC
-1.62
□□□□□ -2.67
SFXN4
Q6P4A7
RNU4-24P-201
ENST00000364565
139 nt
BASIC
-1.62
□□□□□ -2.67
SFXN4
Q6P4A7
RNA5SP266-201
ENST00000410273
108 nt
BASIC
-1.62
□□□□□ -2.67
SFXN4
Q6P4A7
Y_RNA.596-201
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109 nt
BASIC
-1.62
□□□□□ -2.67
SFXN4
Q6P4A7
MIR1270-201
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83 nt
BASIC
-1.62
□□□□□ -2.67
SFXN4
Q6P4A7
RNU6-850P-201
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103 nt
BASIC
-1.62
□□□□□ -2.67
SFXN4
Q6P4A7
Y_RNA.718-201
ENST00000517110
102 nt
BASIC
-1.62
□□□□□ -2.67
SFXN4
Q6P4A7
MIR5704-201
ENST00000584029
77 nt
BASIC
-1.62
□□□□□ -2.67
SFXN4
Q6P4A7
RNU2-4P-201
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192 nt
BASIC
-1.62
□□□□□ -2.67
SFXN4
Q6P4A7
AC092794.1-201
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582 nt
BASIC
-1.62
□□□□□ -2.67
SFXN4
Q6P4A7
KCNQ1OT1_5.1-201
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226 nt
BASIC
-1.62
□□□□□ -2.67
SFXN4
Q6P4A7
Y_RNA.365-201
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102 nt
BASIC
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□□□□□ -2.67
SFXN4
Q6P4A7
SNORD116-29-201
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83 nt
BASIC
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□□□□□ -2.67
SFXN4
Q6P4A7
Y_RNA.541-201
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113 nt
BASIC
-1.63
□□□□□ -2.67
SFXN4
Q6P4A7
MIR1302-11-201
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138 nt
BASIC
-1.63
□□□□□ -2.67
SFXN4
Q6P4A7
MIR1302-9-201
ENST00000408365
138 nt
BASIC
-1.63
□□□□□ -2.67
SFXN4
Q6P4A7
MIR1302-10-201
ENST00000408734
138 nt
BASIC
-1.63
□□□□□ -2.67
SFXN4
Q6P4A7
RNU6-976P-201
ENST00000516086
111 nt
BASIC
-1.63
□□□□□ -2.67
SFXN4
Q6P4A7
RNU6-561P-201
ENST00000516222
102 nt
BASIC
-1.63
□□□□□ -2.67
SFXN4
Q6P4A7
RNU2-35P-201
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142 nt
BASIC
-1.63
□□□□□ -2.67
SFXN4
Q6P4A7
MIR1302-2-201
ENST00000607096
138 nt
BASIC
-1.63
□□□□□ -2.67
SFXN4
Q6P4A7
Y_RNA.3-201
ENST00000362331
103 nt
BASIC
-1.64
□□□□□ -2.67
SFXN4
Q6P4A7
Y_RNA.150-201
ENST00000363562
102 nt
BASIC
-1.64
□□□□□ -2.67
SFXN4
Q6P4A7
Y_RNA.160-201
ENST00000363677
92 nt
BASIC
-1.64
□□□□□ -2.67
SFXN4
Q6P4A7
Y_RNA.384-201
ENST00000383909
102 nt
BASIC
-1.64
□□□□□ -2.67
SFXN4
Q6P4A7
Y_RNA.447-201
ENST00000384184
113 nt
BASIC
-1.64
□□□□□ -2.67
SFXN4
Q6P4A7
Y_RNA.452-201
ENST00000384202
108 nt
BASIC
-1.64
□□□□□ -2.67
SFXN4
Q6P4A7
RNU6-1289P-201
ENST00000384431
106 nt
BASIC
-1.64
□□□□□ -2.67
SFXN4
Q6P4A7
Y_RNA.516-201
ENST00000384541
124 nt
BASIC
-1.64
□□□□□ -2.67
SFXN4
Q6P4A7
MIR548F1-201
ENST00000408667
84 nt
BASIC
-1.64
□□□□□ -2.67
SFXN4
Q6P4A7
AC084782.3-201
ENST00000612282
578 nt
BASIC
-1.64
□□□□□ -2.67
SFXN4
Q6P4A7
MIR4320-201
ENST00000636981
65 nt
BASIC
-1.64
□□□□□ -2.67
SFXN4
Q6P4A7
Y_RNA.6-201
ENST00000362350
114 nt
BASIC
-1.65
□□□□□ -2.67
SFXN4
Q6P4A7
MIR516A2-201
ENST00000384888
90 nt
BASIC
-1.65
□□□□□ -2.67
SFXN4
Q6P4A7
MIR516A1-201
ENST00000385033
90 nt
BASIC
-1.65
□□□□□ -2.67
SFXN4
Q6P4A7
RNU7-152P-201
ENST00000458982
64 nt
BASIC
-1.65
□□□□□ -2.67
SFXN4
Q6P4A7
AC026421.1-201
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163 nt
BASIC
-1.65
□□□□□ -2.67
SFXN4
Q6P4A7
AC040936.1-201
ENST00000534543
172 nt
TSL 5
BASIC
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□□□□□ -2.67
SFXN4
Q6P4A7
TRDV1-202
ENST00000621643
102 nt
BASIC
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□□□□□ -2.67
SFXN4
Q6P4A7
Y_RNA.28-201
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111 nt
BASIC
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□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
SNORD115-35-201
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82 nt
BASIC
-1.66
□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
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166 nt
BASIC
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□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
MIR376B-201
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100 nt
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□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
RNU6-103P-201
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107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
Y_RNA.275-201
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110 nt
BASIC
-1.67
□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
SNORD38.2-201
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BASIC
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□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
SNORD116-6-201
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96 nt
BASIC
-1.67
□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
RNU6-1254P-201
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BASIC
-1.67
□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
RNU6ATAC41P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
AC084781.2-201
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161 nt
BASIC
-1.67
□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
MIR8068-201
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68 nt
BASIC
-1.67
□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
AC087741.2-201
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172 nt
BASIC
-1.67
□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
SNORD27-201
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BASIC
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□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
Y_RNA.207-201
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SFXN4
Q6P4A7
Y_RNA.437-201
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113 nt
BASIC
-1.68
□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
RNU6-381P-201
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108 nt
BASIC
-1.68
□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
HLA-S-202
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BASIC
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□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
snoU83B.1-201
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88 nt
BASIC
-1.68
□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
RNU6-1057P-201
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BASIC
-1.68
□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
RRM2B-207
ENST00000519962
201 nt
TSL 1 (best)
BASIC
-1.68
□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
AC009779.6-201
ENST00000603972
165 nt
BASIC
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□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
U4.1-201
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87 nt
BASIC
-1.68
□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
snoR1.1-201
ENST00000628177
80 nt
BASIC
-1.68
□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
Y_RNA.5-201
ENST00000362334
102 nt
BASIC
-1.69
□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
Y_RNA.389-201
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113 nt
BASIC
-1.69
□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
RNU6-1307P-201
ENST00000391012
103 nt
BASIC
-1.69
□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
RNU6-243P-201
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107 nt
BASIC
-1.69
□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
AL121914.1-201
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BASIC
-1.69
□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
RNU7-164P-201
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62 nt
BASIC
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□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
RNA5SP461-201
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104 nt
BASIC
-1.69
□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
AC021443.1-201
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211 nt
BASIC
-1.69
□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
Y_RNA.64-201
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102 nt
BASIC
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□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
SNORD114-4-201
ENST00000363962
75 nt
BASIC
-1.7
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SFXN4
Q6P4A7
Y_RNA.377-201
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108 nt
BASIC
-1.7
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SFXN4
Q6P4A7
RNU6-476P-201
ENST00000384726
107 nt
BASIC
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□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
Y_RNA.601-201
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113 nt
BASIC
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□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
AC138907.4-201
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226 nt
BASIC
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Q6P4A7
snoU2_19.2-201
ENST00000363024
80 nt
BASIC
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□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
Y_RNA.360-201
ENST00000365512
102 nt
BASIC
-1.71
□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
SERF1AP1-201
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187 nt
BASIC
-1.71
□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
SNORA40.15-201
ENST00000516884
107 nt
BASIC
-1.71
□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
MIR548O2-201
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70 nt
BASIC
-1.71
□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
U6.100-201
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99 nt
BASIC
-1.71
□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
RNU4-17P-201
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BASIC
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□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
SNORD116-2-201
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95 nt
BASIC
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□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
RNU6-905P-201
ENST00000384434
107 nt
BASIC
-1.72
□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
RNU6-1215P-201
ENST00000384441
102 nt
BASIC
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□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
hsa-mir-3607.1-201
ENST00000637229
79 nt
BASIC
-1.72
□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
AC132825.6-201
ENST00000638861
357 nt
BASIC
-1.72
□□□□□ -2.68
SFXN4
Q6P4A7
MIR8485-201
ENST00000401372
91 nt
BASIC
-1.73
□□□□□ -2.69
SFXN4
Q6P4A7
RNU6-121P-201
ENST00000410525
99 nt
BASIC
-1.73
□□□□□ -2.69
SFXN4
Q6P4A7
AC092755.1-201
ENST00000441746
97 nt
TSL 3
BASIC
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□□□□□ -2.69
SFXN4
Q6P4A7
RNA5SP236-201
ENST00000516169
116 nt
BASIC
-1.73
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SFXN4
Q6P4A7
Y_RNA.52-201
ENST00000362760
96 nt
BASIC
-1.74
□□□□□ -2.69
SFXN4
Q6P4A7
Y_RNA.457-201
ENST00000384237
111 nt
BASIC
-1.74
□□□□□ -2.69
SFXN4
Q6P4A7
AC079760.1-201
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202 nt
TSL 3
BASIC
-1.74
□□□□□ -2.69
SFXN4
Q6P4A7
SNORD2.1-201
ENST00000458762
69 nt
BASIC
-1.74
□□□□□ -2.69
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